169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4700 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4700  protein of unknown function DUF1205  100 
 
 
424 aa  839    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.626027  normal  0.337723 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4727  protein of unknown function DUF1205  75.42 
 
 
416 aa  595  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4715  protein of unknown function DUF1205  77.11 
 
 
419 aa  589  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.683026  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4699  protein of unknown function DUF1205  70.5 
 
 
417 aa  527  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.363631  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4711  protein of unknown function DUF1205  63.36 
 
 
429 aa  480  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.890895 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4716  protein of unknown function DUF1205  58.55 
 
 
424 aa  458  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4707  protein of unknown function DUF1205  51.31 
 
 
428 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3487  protein of unknown function DUF1205  38.07 
 
 
417 aa  256  7e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4726  protein of unknown function DUF1205  40.1 
 
 
418 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4361  protein of unknown function DUF1205  37.89 
 
 
411 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000257109  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2112  hypothetical protein  35.14 
 
 
467 aa  183  6e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0819565  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4185  IroB  36.04 
 
 
382 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0479104  normal  0.936172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2933  hypothetical protein  34.46 
 
 
472 aa  140  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697027  normal  0.639426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4360  glycosyl transferase family 28  29.69 
 
 
443 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000448703  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2033  hypothetical protein  30.52 
 
 
378 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0492847  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2047  glycosyl transferase family protein  31.74 
 
 
395 aa  124  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.555181  hitchhiker  0.0026549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1263  hypothetical protein  25.69 
 
 
387 aa  112  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2790  protein of unknown function DUF1205  30.02 
 
 
380 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0162419  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3071  hypothetical protein  26.57 
 
 
371 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2968  hypothetical protein  26.57 
 
 
371 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000610556 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2915  IroB  26.57 
 
 
371 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0618266 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2949  glycosyltransferase  26.57 
 
 
371 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.63295e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2885  IroB  26.57 
 
 
371 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1369  glycosyl transferase  26.23 
 
 
374 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3553  glycosyltransferase, MGT family  28.81 
 
 
390 aa  97.1  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000992125  hitchhiker  0.0041282 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2213  hypothetical protein  27.86 
 
 
380 aa  92.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5567  hypothetical protein  30.31 
 
 
387 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.661467  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2418  glycosyl transferase family protein  23.53 
 
 
397 aa  90.9  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2220  hypothetical protein  33.51 
 
 
346 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1886  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 
403 aa  83.2  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2776  protein of unknown function DUF1205  27.32 
 
 
380 aa  82.8  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00637482  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4978  glycosyltransferase, MGT family  28.97 
 
 
389 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3816  glycosyltransferase, MGT family  28.77 
 
 
383 aa  79.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000289865  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0820  glycosyltransferase, MGT family  26.43 
 
 
398 aa  67  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.894116  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5611  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
396 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126524  hitchhiker  0.000566285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4109  putative glycosyltransferase  32.62 
 
 
456 aa  66.6  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114761 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11390  glycosyltransferase, MGT family  25.07 
 
 
396 aa  64.3  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4034  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
436 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.468428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2328  glycosyl transferase family protein  23.19 
 
 
433 aa  64.7  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0735299  hitchhiker  0.00124939 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4823  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  27.59 
 
 
436 aa  64.3  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1867  glycosyl transferase family protein  35.61 
 
 
419 aa  64.3  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4886  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  35.46 
 
 
411 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3722  glycosyl transferase family protein  34.42 
 
 
393 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.671186  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3135  glycosyltransferase, MGT family  35.53 
 
 
428 aa  62.4  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2497  glycosyltransferase, MGT family  37.5 
 
 
380 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0930  glycosyl transferase family protein  34 
 
 
396 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72237  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5544  glycosyl transferase family 28  24.35 
 
 
416 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00888029 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0972  glycosyltransferase, MGT family  24.83 
 
 
417 aa  61.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4035  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 
432 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.996814  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12972  glycosyl transferase  29.23 
 
 
428 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2711  glycosyltransferase, MGT family  33.33 
 
 
387 aa  59.7  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271214  normal  0.0182222 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2600  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 
398 aa  59.7  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2801  macrolide glycosyltransferase  29.81 
 
 
397 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756004 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3181  glycosyltransferase, MGT family  23.81 
 
 
405 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3199  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  26.7 
 
 
402 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2098  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  30.98 
 
 
433 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.228633  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3248  glycosyltransferase, MGT family  41.57 
 
 
399 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1566  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 
400 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.789406  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2090  glycosyl transferase family 28  34.88 
 
 
424 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685331  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3906  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  32.91 
 
 
449 aa  58.2  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2804  macrolide glycosyltransferase  30.77 
 
 
397 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2825  glycosyltransferase, putative  28.85 
 
 
397 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00274597  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1445  glycosyltransferase, MGT family  23.96 
 
 
399 aa  57  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2846  macrolide glycosyltransferase  28.85 
 
 
397 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0273308  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1446  glycosyltransferase, MGT family  24.41 
 
 
399 aa  56.6  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2248  protein of unknown function DUF1205  36.62 
 
 
370 aa  56.2  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5358  glycosyl transferase family 28  31.17 
 
 
433 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.217134  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1778  glycosyl transferase family protein  28.39 
 
 
402 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.72129 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4507  glycosyl transferase family protein  33.59 
 
 
427 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116165  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2486  macrolide glycosyltransferase  29.81 
 
 
397 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.182202  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2168  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
400 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2409  glycosyl transferase family 28  39.33 
 
 
420 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.187089 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0314  glycosyltransferase 28-like protein  21.35 
 
 
392 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0796  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  27.04 
 
 
416 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1849  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  34.23 
 
 
412 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12976  glycosyl transferase  32.4 
 
 
449 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1565  glycosyl transferase family protein  20.76 
 
 
409 aa  54.3  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.906358  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2021  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
402 aa  54.3  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2132  glycosyl transferase family protein  39.33 
 
 
420 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.257831 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5063  UDP-glycosyltransferase, MGT  27.61 
 
 
412 aa  53.5  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3283  glycosyltransferase, MGT family  31.74 
 
 
424 aa  53.5  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2408  glycosyltransferase family 28 protein  21.93 
 
 
447 aa  53.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5032  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 
427 aa  53.9  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2652  Glycosyltransferase 28 domain protein  41.48 
 
 
423 aa  53.5  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00514492  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2896  glycosyltransferase, MGT family  33.72 
 
 
330 aa  53.5  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4929  glycosyltransferase, MGT family  27.07 
 
 
426 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71822  normal  0.477564 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1076  rhamnosyltransferase I, subunit B  37.5 
 
 
475 aa  53.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000121817  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1880  rhamnosyltransferase I, subunit B  37.5 
 
 
475 aa  53.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000550735  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3579  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
418 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00269686  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3223  glycosyltransferase, MGT family  27.78 
 
 
446 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1898  glycosyltransferase; macrolide glycosyltransferase  26.05 
 
 
402 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000618321  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0921  rhamnosyltransferase I, subunit B  37.5 
 
 
439 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.181372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0373  rhamnosyltransferase I, subunit B  37.5 
 
 
439 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00103797  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2095  rhamnosyltransferase I, subunit B  35.82 
 
 
439 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000117382  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6314  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
402 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1700  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 
411 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125304  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1019  rhamnosyltransferase I, subunit B  37.5 
 
 
439 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000449515  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0725  rhamnosyltransferase I, subunit B  35.82 
 
 
439 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1832  rhamnosyltransferase I, subunit B  35.82 
 
 
439 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1421  rhamnosyltransferase I, subunit B  37.5 
 
 
439 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>