198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3223 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1105  glycosyltransferase, MGT family  88.86 
 
 
429 aa  769    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3223  glycosyltransferase, MGT family  100 
 
 
446 aa  905    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3283  glycosyltransferase, MGT family  71.23 
 
 
424 aa  628  1e-179  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0705  glycosyl transferase family protein  68.32 
 
 
423 aa  585  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4109  putative glycosyltransferase  42.29 
 
 
456 aa  341  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114761 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4659  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  42.24 
 
 
443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.717417  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3906  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  36.04 
 
 
449 aa  259  7e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3877  glycosyl transferase family protein  36.81 
 
 
440 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123353 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4034  glycosyl transferase family protein  37.14 
 
 
436 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.468428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2098  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  35.66 
 
 
433 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.228633  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5358  glycosyl transferase family 28  35.44 
 
 
433 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.217134  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4035  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
432 aa  235  9e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.996814  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3573  glycosyl transferase family protein  35.21 
 
 
434 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3646  glycosyl transferase family protein  35.21 
 
 
434 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3578  glycosyl transferase family protein  35.21 
 
 
434 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6241  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  33.65 
 
 
443 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2592  glycosyl transferase family protein  35.87 
 
 
436 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4043  protein of unknown function DUF1205  37.7 
 
 
407 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.392322  normal  0.322652 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6239  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  34.98 
 
 
415 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0770059  normal  0.903811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4886  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  35.91 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1849  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  36.48 
 
 
412 aa  203  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2328  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 
433 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0735299  hitchhiker  0.00124939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5051  hypothetical protein  34.63 
 
 
451 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1940  putative glycosyltransferase  29.57 
 
 
440 aa  179  7e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3135  glycosyltransferase, MGT family  33.67 
 
 
428 aa  170  6e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215343 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3970  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  28.37 
 
 
426 aa  166  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00770108  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2594  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  28.31 
 
 
455 aa  152  8.999999999999999e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00128778  hitchhiker  0.000911966 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2942  glycosyltransferase, MGT family  31.53 
 
 
426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115511 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5223  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 
418 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0184372  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3897  Glycosyltransferase 28 domain protein  26.06 
 
 
429 aa  95.5  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3114  Glycosyl transferase-like UDP- glucuronosyltransferase  25.37 
 
 
379 aa  90.1  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.826951  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1269  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
426 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1286  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
426 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.540508  normal  0.192884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1296  glycosyl transferase family protein  26.65 
 
 
426 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.205066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2103  glycosyltransferase family 28 protein  27.38 
 
 
427 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646286  normal  0.972852 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1905  glycosyl transferase family protein  25.46 
 
 
407 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2652  Glycosyltransferase 28 domain protein  25.06 
 
 
423 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00514492  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02563  conserved hypothetical protein  31.94 
 
 
156 aa  82.4  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2600  glycosyl transferase family protein  21.88 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5430  putative glycosyltransferase (N-glycosyltransferase) (N-glycosyl transferase NGT)  33.74 
 
 
168 aa  81.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2325  glycosyltransferase, MGT family  27.5 
 
 
406 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8226  hypothetical protein  23.56 
 
 
407 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2801  macrolide glycosyltransferase  22.43 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756004 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2825  glycosyltransferase, putative  23.13 
 
 
397 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00274597  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0466  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 
414 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00234533  normal  0.19115 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02010  conserved hypothetical protein  29.97 
 
 
342 aa  79.3  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.689607 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2168  glycosyl transferase family protein  22.36 
 
 
400 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3139  glycosyl transferase  22.3 
 
 
400 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.924253  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1445  glycosyltransferase, MGT family  25.23 
 
 
399 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1565  glycosyl transferase family protein  22.38 
 
 
409 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.906358  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2111  glycosyl transferase family protein  27.22 
 
 
425 aa  77.8  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000775281  normal  0.550046 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2846  macrolide glycosyltransferase  22.43 
 
 
397 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0273308  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2842  glycosyl transferase family protein  25.24 
 
 
422 aa  77  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.142528  normal  0.0240997 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2408  glycosyltransferase family 28 protein  22.55 
 
 
447 aa  76.6  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4929  glycosyltransferase, MGT family  24.1 
 
 
426 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71822  normal  0.477564 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1002  glycosyltransferase family 28 protein  32.14 
 
 
451 aa  76.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1935  glycosyl transferase family protein  22.79 
 
 
402 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0505353  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1888  glycosyltransferase; macrolide glycosyltransferase  22.6 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.213265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2182  glycosyltransferase, MGT family  22.44 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2327  glycosyltransferase, MGT family  26.55 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12972  glycosyl transferase  30.86 
 
 
428 aa  73.2  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1936  glycosyl transferase family protein  22.55 
 
 
402 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.527298  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1898  glycosyltransferase; macrolide glycosyltransferase  22.36 
 
 
402 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000618321  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2083  glycosyl transferase family protein  22.55 
 
 
402 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2114  glycosyltransferase, MGT family  22.55 
 
 
403 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1381  glycosyltransferase, MGT family  24.46 
 
 
430 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0109047  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3181  glycosyltransferase, MGT family  21.65 
 
 
405 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2073  glycosyltransferase, MGT family  20.49 
 
 
402 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3232  glycosyltransferase, MGT family  20.73 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.26433 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2711  glycosyltransferase, MGT family  33.33 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271214  normal  0.0182222 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12976  glycosyl transferase  31.19 
 
 
449 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4408  glycosyltransferase, MGT family  22.69 
 
 
389 aa  70.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3579  glycosyl transferase family protein  24.04 
 
 
418 aa  70.1  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00269686  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4711  protein of unknown function DUF1205  31.33 
 
 
429 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.890895 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1906  glycosyl transferase family protein  23.92 
 
 
403 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2804  macrolide glycosyltransferase  26.46 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1988  putative glycosyl transferase  31.03 
 
 
423 aa  67.4  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0156552  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2486  macrolide glycosyltransferase  25.54 
 
 
397 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.182202  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4823  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  26.63 
 
 
436 aa  66.6  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1781  hypothetical protein  28.98 
 
 
380 aa  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3273  glycosyl transferase family protein  22.62 
 
 
427 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0719433  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2036  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 
397 aa  66.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746123 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11390  glycosyltransferase, MGT family  22.65 
 
 
396 aa  66.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0972  glycosyltransferase, MGT family  30.41 
 
 
417 aa  65.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3199  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  27.27 
 
 
402 aa  65.1  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2041  putative glycosyl transferase  28.57 
 
 
406 aa  64.3  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221622  normal  0.0364064 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5095  glycosyl transferase family protein  22.38 
 
 
427 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509328  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5187  glycosyl transferase family protein  22.14 
 
 
429 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00893984  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32980  glycosyltransferase, MGT family  26.94 
 
 
381 aa  63.2  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3843  Glycosyltransferase 28 domain protein  22.08 
 
 
434 aa  63.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2502  glycosyl transferase family protein  20.24 
 
 
391 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000624738  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0373  rhamnosyltransferase I, subunit B  20.75 
 
 
439 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00103797  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1566  glycosyl transferase family protein  22.2 
 
 
400 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.789406  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1886  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 
403 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2664  glycosyl transferase, putative  22.31 
 
 
392 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.38781  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9626  glycosyltransferase  26.6 
 
 
465 aa  61.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0296373  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2662  glycosyl transferase  20.51 
 
 
395 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1446  glycosyltransferase, MGT family  25.98 
 
 
399 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0921  rhamnosyltransferase I, subunit B  20.75 
 
 
439 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.181372  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1019  rhamnosyltransferase I, subunit B  20.75 
 
 
439 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000449515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>