117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1940 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1940  putative glycosyltransferase  100 
 
 
440 aa  908    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3970  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  47.6 
 
 
426 aa  369  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00770108  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2594  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  36.41 
 
 
455 aa  262  8.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00128778  hitchhiker  0.000911966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4109  putative glycosyltransferase  35.15 
 
 
456 aa  234  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114761 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3906  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  30.42 
 
 
449 aa  195  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4659  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  33.66 
 
 
443 aa  194  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.717417  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4034  glycosyl transferase family protein  31.27 
 
 
436 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.468428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2098  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  30.07 
 
 
433 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.228633  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5358  glycosyl transferase family 28  33.83 
 
 
433 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.217134  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1105  glycosyltransferase, MGT family  29.46 
 
 
429 aa  180  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3223  glycosyltransferase, MGT family  29.57 
 
 
446 aa  179  7e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3283  glycosyltransferase, MGT family  29.93 
 
 
424 aa  176  7e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6241  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  28.27 
 
 
443 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0705  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 
423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3573  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
434 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3646  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
434 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3578  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 
434 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4035  glycosyl transferase family protein  35.57 
 
 
432 aa  172  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.996814  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2328  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
433 aa  172  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0735299  hitchhiker  0.00124939 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4043  protein of unknown function DUF1205  32.38 
 
 
407 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.392322  normal  0.322652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2592  glycosyl transferase family protein  29.98 
 
 
436 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4886  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  32.06 
 
 
411 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2174  hypothetical protein  36.12 
 
 
235 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3877  glycosyl transferase family protein  30.72 
 
 
440 aa  150  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123353 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1849  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  29.24 
 
 
412 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5051  hypothetical protein  30.65 
 
 
451 aa  144  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6239  UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase  32.78 
 
 
415 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0770059  normal  0.903811 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2942  glycosyltransferase, MGT family  27.61 
 
 
426 aa  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115511 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3135  glycosyltransferase, MGT family  28.99 
 
 
428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215343 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3181  glycosyltransferase, MGT family  21.57 
 
 
405 aa  87.4  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5430  putative glycosyltransferase (N-glycosyltransferase) (N-glycosyl transferase NGT)  33.13 
 
 
168 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2600  glycosyl transferase family protein  21.19 
 
 
398 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02563  conserved hypothetical protein  37.04 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2182  glycosyltransferase, MGT family  20.94 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2502  glycosyl transferase family protein  22.56 
 
 
391 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000624738  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2804  macrolide glycosyltransferase  21.64 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02010  conserved hypothetical protein  26.97 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.689607 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2842  glycosyl transferase family protein  22.53 
 
 
422 aa  81.3  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.142528  normal  0.0240997 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2801  macrolide glycosyltransferase  20.9 
 
 
397 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756004 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2846  macrolide glycosyltransferase  21.23 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0273308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1888  glycosyltransferase; macrolide glycosyltransferase  20.69 
 
 
402 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.213265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1898  glycosyltransferase; macrolide glycosyltransferase  20.94 
 
 
402 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000618321  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2073  glycosyltransferase, MGT family  20.39 
 
 
402 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2664  glycosyl transferase, putative  22.35 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.38781  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1269  glycosyl transferase family protein  22.27 
 
 
426 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1286  glycosyl transferase family protein  22.27 
 
 
426 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.540508  normal  0.192884 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1935  glycosyl transferase family protein  21.13 
 
 
402 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0505353  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3139  glycosyl transferase  21.46 
 
 
400 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.924253  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3232  glycosyltransferase, MGT family  20.52 
 
 
402 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.26433 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2825  glycosyltransferase, putative  20.65 
 
 
397 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00274597  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1566  glycosyl transferase family protein  19.95 
 
 
400 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.789406  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2168  glycosyl transferase family protein  20.44 
 
 
400 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2421  glycosyl transferase  20.25 
 
 
392 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0361033  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1296  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 
426 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.205066 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2662  glycosyl transferase  20.87 
 
 
395 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.925673  hitchhiker  0.000211315 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1936  glycosyl transferase family protein  20.2 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.527298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2083  glycosyl transferase family protein  20.2 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2114  glycosyltransferase, MGT family  20.2 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2382  glycosyl transferase  19.95 
 
 
392 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172083  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5223  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 
418 aa  73.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0184372  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0466  glycosyl transferase family protein  23.68 
 
 
414 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00234533  normal  0.19115 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2111  glycosyl transferase family protein  23.26 
 
 
425 aa  73.2  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000775281  normal  0.550046 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3114  hypothetical protein  24.53 
 
 
436 aa  72.8  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0053335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2655  putative glycosyl transferase  20.05 
 
 
392 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000652274 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1565  glycosyl transferase family protein  19.18 
 
 
409 aa  72  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.906358  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3897  Glycosyltransferase 28 domain protein  24.88 
 
 
429 aa  71.6  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2327  glycosyltransferase, MGT family  20.93 
 
 
398 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2662  glycosyl transferase  19.68 
 
 
395 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2486  macrolide glycosyltransferase  20.33 
 
 
397 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.182202  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2458  glycosyl transferase  20.05 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.091231  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3570  glycosyltransferase, MGT family  21.48 
 
 
419 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0172667  normal  0.0986761 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2638  glycosyl transferase  19.8 
 
 
387 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.408902  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4929  glycosyltransferase, MGT family  24.06 
 
 
426 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71822  normal  0.477564 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2103  glycosyltransferase family 28 protein  20.76 
 
 
427 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646286  normal  0.972852 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0972  glycosyltransferase, MGT family  22.89 
 
 
417 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2966  glycosyl transferase family protein  23.34 
 
 
408 aa  60.1  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2325  glycosyltransferase, MGT family  20.59 
 
 
406 aa  60.1  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5063  UDP-glycosyltransferase, MGT  20.36 
 
 
412 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1381  glycosyltransferase, MGT family  23.44 
 
 
430 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0109047  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1905  glycosyl transferase family protein  22.91 
 
 
407 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1700  glycosyl transferase family protein  20.69 
 
 
411 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1445  glycosyltransferase, MGT family  24 
 
 
399 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32980  glycosyltransferase, MGT family  24.1 
 
 
381 aa  52.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2652  Glycosyltransferase 28 domain protein  20.92 
 
 
423 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00514492  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1886  glycosyl transferase family protein  21.6 
 
 
403 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0820  glycosyltransferase, MGT family  22.97 
 
 
398 aa  50.8  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.894116  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29850  glycosyltransferase, MGT family  24.71 
 
 
404 aa  50.1  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1446  glycosyltransferase, MGT family  22.81 
 
 
399 aa  50.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5611  glycosyl transferase family protein  21.27 
 
 
396 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126524  hitchhiker  0.000566285 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1778  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 
402 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.72129 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1867  glycosyl transferase family protein  21.21 
 
 
419 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6314  glycosyl transferase family protein  20.8 
 
 
402 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1765  glycosyl transferase family protein  20.8 
 
 
402 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2497  glycosyltransferase, MGT family  24.24 
 
 
380 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2776  protein of unknown function DUF1205  23.87 
 
 
380 aa  47.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00637482  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11390  glycosyltransferase, MGT family  19.82 
 
 
396 aa  46.6  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8226  hypothetical protein  21.55 
 
 
407 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0930  glycosyl transferase family protein  20.94 
 
 
396 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72237  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2790  protein of unknown function DUF1205  26.56 
 
 
380 aa  45.8  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0162419  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3811  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  29.08 
 
 
365 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>