40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4107 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4107  Protein of unknown function DUF2087  100 
 
 		 165 aa  326  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.645 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0055  hypothetical protein  34.18 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6202  hypothetical protein  41.67 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1246  hypothetical protein  43.59 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.898285 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4198  Protein of unknown function DUF2087  33.72 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3787  Protein of unknown function DUF2087  39.19 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666122  normal  0.228375 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3346  hypothetical protein  43.08 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0453  hypothetical protein  53.06 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597962  hitchhiker  0.00422239 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1770  hypothetical protein  34.72 
 
 		 254 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1822  hypothetical protein  34.72 
 
 		 254 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1640  hypothetical protein  34.72 
 
 		 254 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.949601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1620  hypothetical protein  34.72 
 
 		 254 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1417  hypothetical protein  36.11 
 
 		 254 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.785272  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2463  hypothetical protein  31.43 
 
 		 251 aa  52.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862525  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1845  hypothetical protein  34.72 
 
 		 254 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.964527  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3531  regulatory protein, ArsR  27.68 
 
 		 339 aa  52  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1898  hypothetical protein  34.72 
 
 		 254 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00577202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1590  hypothetical protein  34.72 
 
 		 254 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.866908  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1640  transcriptional regulator  36.11 
 
 		 254 aa  50.4  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 309 aa  50.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1786  hypothetical protein  29.41 
 
 		 254 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3558  hypothetical protein  34.72 
 
 		 254 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.384967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 192 aa  48.9  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0834  hypothetical protein  34.08 
 
 		 186 aa  48.5  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.763515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0452  hypothetical protein  29.85 
 
 		 155 aa  48.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.683451  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19040  hypothetical protein  41.03 
 
 		 148 aa  48.1  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3484  hypothetical protein  35.53 
 
 		 182 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.280863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0199  hypothetical protein  29.75 
 
 		 167 aa  48.1  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0994  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 106 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3162  regulatory protein, LuxR  32.47 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2627  hypothetical protein  34.67 
 
 		 199 aa  44.7  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02330  uncharacterized conserved protein (DUF2087)  37.5 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1499  ArsR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 103 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1761  hypothetical protein  28.74 
 
 		 96 aa  43.9  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0310951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0998  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 106 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1182  hypothetical protein  27.03 
 
 		 100 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2232  hypothetical protein  40.74 
 
 		 147 aa  42  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2803  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 216 aa  41.2  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3702  ArsR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 196 aa  40.4  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>