18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2715 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2715  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  239  6e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.605937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7450  hypothetical protein  57.8 
 
 
117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.955905  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3136  hypothetical protein  57.39 
 
 
121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1879  hypothetical protein  58.1 
 
 
121 aa  122  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.880984  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1077  protein of unknown function DUF419  38.14 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.177675  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4027  hypothetical protein  36.79 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.998765  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3092  protein of unknown function DUF661  34 
 
 
114 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198435  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2827  hypothetical protein  35.42 
 
 
119 aa  50.1  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4338  hypothetical protein  35.45 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0504151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3874  hypothetical protein  32.67 
 
 
120 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0480065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6405  hypothetical protein  31.45 
 
 
131 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.235405 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0225  hypothetical protein  33.68 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2141  hypothetical protein  29.9 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.562387  normal  0.0156021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4568  hypothetical protein  27.83 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.923799  normal  0.48962 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1426  protein of unknown function DUF661  46.3 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0193  hypothetical protein  32.32 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.552024 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0031  hypothetical protein  31.53 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247027  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0136  hypothetical protein  31.19 
 
 
118 aa  41.2  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.195984  normal  0.314432 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>