19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1165 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1165  putative ABC transporter  100 
 
 		 399 aa  769    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.384071 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6285  hypothetical protein  42.56 
 
 		 379 aa  261  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5109  hypothetical protein  39.89 
 
 		 407 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11867  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2857  lipoprotein  38.44 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5325  ABC-3 protein  38.5 
 
 		 664 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1072  hypothetical protein  35.25 
 
 		 445 aa  170  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4810  putative ABC transporter  38.49 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.582677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4724  putative ABC transporter  38.49 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260926  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36800  hypothetical protein  28.32 
 
 		 482 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0161837  normal  0.220338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0087  pyrrolo-quinoline quinone  29.83 
 
 		 454 aa  60.5  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0152  pyrrolo-quinoline quinone  28.42 
 
 		 429 aa  53.1  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0563094 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30770  hypothetical protein  30.74 
 
 		 444 aa  52.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2378  hypothetical protein  27.1 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.898929  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1380  hypothetical protein  25 
 
 		 447 aa  47  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.369053  normal  0.0607438 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2434  hypothetical protein  35.56 
 
 		 414 aa  47  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2837  hypothetical protein  30.65 
 
 		 383 aa  46.2  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0090  Pyrrolo-quinoline quinone  40.74 
 
 		 444 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4108  putative secreted protein  25.26 
 
 		 455 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4097  hypothetical protein  26.38 
 
 		 412 aa  43.1  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>