18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4658 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4658  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  495  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4205  hypothetical protein  52.52 
 
 		 276 aa  214  8e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.548465 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4635  hypothetical protein  46.13 
 
 		 276 aa  198  7.999999999999999e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.616859  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0475  lipoprotein  52.87 
 
 		 279 aa  191  9e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.786291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3105  hypothetical protein  53.47 
 
 		 280 aa  183  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58027  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0372  lipoprotein  51.68 
 
 		 277 aa  180  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3473  lipoprotein  53.05 
 
 		 273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3257  lipoprotein  52.69 
 
 		 235 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0735939  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0220  lipoprotein  53.73 
 
 		 277 aa  171  7.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3055  lipoprotein  49.75 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1578  hypothetical protein  36.13 
 
 		 240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000507242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2642  hypothetical protein  35.65 
 
 		 240 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0107943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2469  cell wall anchor domain-containing protein  36.17 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2340  cell wall anchor domain-containing protein  35.33 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2144  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  34.97 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.891643  hitchhiker  0.000531775 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1389  hypothetical protein  31.25 
 
 		 232 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0507165 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0999  cell wall anchor domain-containing protein  31.74 
 
 		 224 aa  49.3  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000353845  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2803  hypothetical protein  33.53 
 
 		 715 aa  47  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.549688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>