26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4516 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4516  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  560  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2876  hypothetical protein  47.73 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5578  hypothetical protein  34.44 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0508  hypothetical protein  33.96 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.647298  normal  0.0833781 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1303  hypothetical protein  35.21 
 
 		 300 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.138879  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0654  hypothetical protein  33.71 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.163272  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0787  hypothetical protein  33.58 
 
 		 312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251982  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1931  hypothetical protein  31.7 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3139  hypothetical protein  31.58 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6554  hypothetical protein  38.89 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01415  hypothetical protein  33.72 
 
 		 307 aa  116  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.134141  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3270  hypothetical protein  29.6 
 
 		 303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5454  hypothetical protein  31.76 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.806789  normal  0.501577 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6339  hypothetical protein  32.67 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4573  hypothetical protein  35.52 
 
 		 293 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0767452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2054  hypothetical protein  33.33 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0911  hypothetical protein  34.15 
 
 		 300 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.442547 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11069  hypothetical protein  43.79 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.204604 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0082  hypothetical protein  34.89 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5649  hypothetical protein  37.31 
 
 		 230 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00621516  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1285  abortive infection protein AbiGII  28.92 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0680  hypothetical protein  31.69 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0557  hypothetical protein  33.52 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000428757 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22780  protein of unknown function (DUF1814)  26.86 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.329909  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1070  hypothetical protein  29.21 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3282  hypothetical protein  29.85 
 
 		 299 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>