15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1788 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1788  hypothetical protein  100 
 
 		 960 aa  1868    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0736583  normal  0.105048 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22950  hypothetical protein  44.05 
 
 		 945 aa  537  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.544258 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3029  hypothetical protein  31.65 
 
 		 713 aa  152  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0560209  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4343  hypothetical protein  28.97 
 
 		 913 aa  124  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316221  normal  0.363569 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2907  hypothetical protein  27.96 
 
 		 809 aa  121  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.415179 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1795  hypothetical protein  27.62 
 
 		 680 aa  118  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0505644  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3973  hypothetical protein  28.64 
 
 		 877 aa  107  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0974285  normal  0.211682 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5962  hypothetical protein  27.11 
 
 		 935 aa  106  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060576 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3836  hypothetical protein  27.95 
 
 		 828 aa  97.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1652  hypothetical protein  25.32 
 
 		 869 aa  96.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.296706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4031  hypothetical protein  23.15 
 
 		 1120 aa  89.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2824  hypothetical protein  29.92 
 
 		 1241 aa  82.8  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0780717  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5544  hypothetical protein  27.05 
 
 		 916 aa  71.2  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.936805  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5937  hypothetical protein  28.57 
 
 		 935 aa  68.2  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2474  hypothetical protein  27.27 
 
 		 887 aa  63.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>