26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1397 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1397  FHA domain containing protein  100 
 
 
512 aa  975    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0172432  normal  0.166225 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1473  Forkhead-associated protein  54.49 
 
 
485 aa  160  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0144762  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3973  FHA domain-containing protein  31.79 
 
 
446 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.825925  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0737  FHA domain-containing protein  45.33 
 
 
498 aa  146  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38821  hitchhiker  0.00771309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5899  hypothetical protein  44.87 
 
 
471 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.529842  normal  0.0437244 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1841  forkhead-associated protein  44.08 
 
 
334 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.521298  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3539  Forkhead-associated protein  36.11 
 
 
371 aa  115  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.953767  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07540  FHA domain-containing protein  34.93 
 
 
614 aa  83.2  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1337  FHA domain containing protein  30.52 
 
 
697 aa  81.3  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000206516 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1293  FHA domain-containing protein  29.54 
 
 
598 aa  80.9  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.584105  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21550  FHA domain-containing protein  31.48 
 
 
888 aa  77.4  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4098  FHA domain containing protein  38.32 
 
 
325 aa  74.7  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2200  FHA domain containing protein  39.25 
 
 
585 aa  61.6  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632754  decreased coverage  0.00361499 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  33.57 
 
 
2449 aa  59.7  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0490  FHA domain containing protein  32.41 
 
 
578 aa  59.3  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.148331  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  28.21 
 
 
1888 aa  52.4  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1520  FHA domain-containing protein  41.76 
 
 
1065 aa  52  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00810345  decreased coverage  0.000340593 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21570  predicted membrane protein/domain  32.41 
 
 
668 aa  50.8  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.497077  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1335  RDD domain containing protein  33.64 
 
 
451 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000041678 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0457  FHA domain containing protein  34.55 
 
 
534 aa  49.3  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0756  FHA domain containing protein  31.25 
 
 
514 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1823  FHA domain-containing protein  37.96 
 
 
863 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.997566  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2521  FHA domain-containing protein  43.28 
 
 
946 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.295094 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1756  FHA domain containing protein  43.75 
 
 
564 aa  44.3  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  47.92 
 
 
455 aa  44.3  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3212  FHA domain containing protein  28.83 
 
 
463 aa  43.9  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.945848  normal  0.211646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>