28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1329 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1329  hypothetical protein  100 
 
 		 1001 aa  1915    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.031741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4818  Fibronectin type III domain protein  40.12 
 
 		 2069 aa  536  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1331  Fibronectin type III domain protein  36.11 
 
 		 2040 aa  464  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211706 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1287  fibronectin, type III domain-containing protein  36.28 
 
 		 2011 aa  452  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111865  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  34.98 
 
 		 2056 aa  444  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1286  fibronectin, type III domain-containing protein  35.18 
 
 		 2051 aa  442  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  33.75 
 
 		 2067 aa  428  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  35.39 
 
 		 2039 aa  422  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05620  fibronectin type III domain-containing protein  34.86 
 
 		 2052 aa  413  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.691963  normal  0.30022 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2198  Fibronectin type III domain protein  35.87 
 
 		 2047 aa  412  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0185742 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0484  Fibronectin type III domain protein  35.71 
 
 		 2027 aa  395  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  32.55 
 
 		 2084 aa  384  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0459  Fibronectin type III domain protein  34.45 
 
 		 2043 aa  370  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0957  hypothetical protein  30.68 
 
 		 1994 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.736873  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  25.17 
 
 		 1597 aa  68.6  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  25.3 
 
 		 721 aa  58.2  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  27.5 
 
 		 4848 aa  58.2  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  26.37 
 
 		 2816 aa  55.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  24.61 
 
 		 1367 aa  54.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  27.15 
 
 		 1215 aa  54.3  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  27.15 
 
 		 1215 aa  54.3  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  27.88 
 
 		 1215 aa  52.4  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  26.92 
 
 		 1215 aa  50.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  32 
 
 		 3816 aa  50.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.92 
 
 		 1215 aa  50.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  27.51 
 
 		 3191 aa  48.9  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  26.67 
 
 		 663 aa  47.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  38.96 
 
 		 5769 aa  44.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>