31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3957 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3957  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  658    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450887  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2624  hypothetical protein  91.08 
 
 
325 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4811  hypothetical protein  70.09 
 
 
509 aa  450  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3455  hypothetical protein  49.69 
 
 
338 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6583  hypothetical protein  47.02 
 
 
346 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0167572 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5647  hypothetical protein  47.02 
 
 
346 aa  298  8e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.999402  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3314  hypothetical protein  47.45 
 
 
346 aa  296  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.59573 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0442  hypothetical protein  46.39 
 
 
347 aa  292  4e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.773186  normal  0.498356 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3609  hypothetical protein  48.23 
 
 
351 aa  288  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5963  hypothetical protein  45.45 
 
 
356 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0133958 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0172  hypothetical protein  45.6 
 
 
359 aa  279  4e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3180  hypothetical protein  45.45 
 
 
353 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0794119 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4809  hypothetical protein  45.89 
 
 
344 aa  256  4e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1933  hypothetical protein  31.03 
 
 
315 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0865  hypothetical protein  31.69 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149678  normal  0.13788 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58975  predicted protein  23.75 
 
 
396 aa  83.2  0.000000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.790136  normal  0.237015 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00867  conserved hypothetical protein  25 
 
 
366 aa  81.3  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.284571 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2373  hypothetical protein  30.71 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.780388  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5139  hypothetical protein  25.61 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10123  conserved hypothetical protein  28.74 
 
 
433 aa  75.5  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04673  conserved hypothetical protein  25.19 
 
 
489 aa  72.4  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32780  predicted protein  26.69 
 
 
422 aa  69.7  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2574  hypothetical protein  27.08 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52502  predicted protein  27.72 
 
 
337 aa  68.9  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0548873  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30337  conserved hypothetical protein  23.79 
 
 
442 aa  62.4  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.18618 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04122  conserved hypothetical protein  23.88 
 
 
418 aa  56.2  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.717308 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2221  hypothetical protein  30.72 
 
 
291 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.853189  normal  0.634217 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02881  conserved hypothetical protein  26.9 
 
 
441 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.406918 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1780  hypothetical protein  25.32 
 
 
264 aa  47.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443384  normal  0.229108 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1017  hypothetical protein  28.03 
 
 
255 aa  46.2  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00283953  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1963  hypothetical protein  26.74 
 
 
317 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.435918  normal  0.990238 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>