37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2192 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2192  Fusaric acid resistance protein conserved region  100 
 
 		 671 aa  1326    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2120  membrane protein, putative efflux pump  55.95 
 
 		 680 aa  617  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3974  fusaric acid resistance protein region  52.85 
 
 		 720 aa  587  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0215831 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4578  fusaric acid resistance protein region  52.13 
 
 		 699 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.108784  hitchhiker  0.00000435415 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4113  fusaric acid resistance protein region  53.44 
 
 		 679 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.981168  normal  0.0322615 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4353  fusaric acid resistance protein region  50.08 
 
 		 665 aa  546  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5579  fusaric acid resistance protein region  50.16 
 
 		 688 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.152208  hitchhiker  0.00845324 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4721  fusaric acid resistance protein region  50.16 
 
 		 688 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00201941 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3646  fusaric acid resistance protein region  50.16 
 
 		 688 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0600324  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4511  fusaric acid resistance protein  48.28 
 
 		 663 aa  535  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0194  fusaric acid resistance protein region  45.26 
 
 		 660 aa  442  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.140662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0595  fusaric acid resistance protein region  36.96 
 
 		 633 aa  347  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0534  fusaric acid resistance domain-containing protein  36.96 
 
 		 633 aa  347  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0240  putative multidrug resistance protein MdtO  38.83 
 
 		 600 aa  345  2e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1055  membrane protein-like  58.52 
 
 		 773 aa  313  9e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00532774  normal  0.601759 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6555  multidrug efflux system protein MdtO  28.52 
 
 		 708 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4326  multidrug efflux system protein MdtO  30.94 
 
 		 683 aa  130  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5589  multidrug efflux system protein MdtO  30.97 
 
 		 683 aa  130  9.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4638  multidrug efflux system protein MdtO  31.05 
 
 		 683 aa  130  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4545  multidrug efflux system protein MdtO  30.94 
 
 		 683 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03953  predicted multidrug efflux system component  31.05 
 
 		 683 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03913  hypothetical protein  31.05 
 
 		 683 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3946  multidrug efflux system protein MdtO  31.05 
 
 		 683 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3911  Fusaric acid resistance protein conserved region  30.72 
 
 		 683 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  33.69 
 
 		 698 aa  62.8  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  34.74 
 
 		 697 aa  62  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  32.34 
 
 		 713 aa  54.3  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4934  fusaric acid resistance protein region  28.09 
 
 		 687 aa  50.4  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  31.55 
 
 		 670 aa  50.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  27.41 
 
 		 625 aa  47.8  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4805  hypothetical protein  30.37 
 
 		 379 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337418  normal  0.112306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.76 
 
 		 697 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  29.45 
 
 		 682 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  27.46 
 
 		 718 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  25.81 
 
 		 687 aa  46.2  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  31.93 
 
 		 659 aa  45.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.75 
 
 		 700 aa  44.3  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>