15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1563 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1563  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 115 aa  228  3e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.223033  normal  0.067732 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2084  transcriptional regulator, TrmB  64.15 
 
 		 111 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1566  transcriptional regulator, TrmB  40.43 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.449969  normal  0.0696439 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2081  transcriptional regulator, TrmB  38.3 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1032  transcriptional regulator, TrmB  40.66 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.325254  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2027  transcriptional regulator, TrmB  38.46 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1438  transcriptional regulator, TrmB  35.05 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2349  putative transcriptional regulator  39.66 
 
 		 214 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1397  transcriptional regulator, TrmB  32.97 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000176396 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1436  transcriptional regulator, TrmB  34.72 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2175  transcriptional regulator, TrmB  34.33 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000302523 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0146  transcriptional regulator, TrmB  34.52 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4305  transcriptional regulator  30.14 
 
 		 261 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  36.84 
 
 		 389 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1844  putative transcriptional regulator  30.56 
 
 		 271 aa  40  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000755788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>