28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0913 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0913  hydrogenase expression/synthesis, HypA  100 
 
 		 142 aa  288  1e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.533701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0192  hydrogenase expression/synthesis, HypA  47.76 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.342154 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0412  hydrogenase expression/synthesis HypA  45.52 
 
 		 136 aa  140  7e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.65842  normal  0.014846 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1306  hydrogenase expression/synthesis, HypA  44.78 
 
 		 136 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.551404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1569  hypothetical protein  46.27 
 
 		 134 aa  127  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0595  hydrogenase expression/synthesis, HypA  37.04 
 
 		 146 aa  83.6  8e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0679  hydrogenase expression/synthesis HypA  30.65 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0074  hydrogenase nickel incorporation protein  31.15 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0047  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.5 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.729496  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1898  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.95 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030561 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1272  hydrogenase expression/synthesis HypA  23.2 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00563885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4095  hydrogenase nickel insertion protein HypA  23.02 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1755  hydrogenase expression/synthesis, HypA  30.95 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3821  hydrogenase expression/synthesis, HypA  24.82 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.631833  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2039  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.59 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0024  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.33 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1601  hydrogenase expression/formation protein HypA  26.57 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1312  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.78 
 
 		 124 aa  42.7  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.183379  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3979  hydrogenase expression/synthesis, HypA  23.02 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0963  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.05 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.225811 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.91 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1669  hydrogenase expression/formation protein HypA  24.65 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3140  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.89 
 
 		 110 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1424  hydrogenase expression/synthesis, HypA  24.46 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5246  hydrogenase nickel insertion protein HypA  24.66 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.911975 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2113  hydrogenase expression/synthesis, HypA  25 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00315228  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1904  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.19 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0320929  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1937  hydrogenase expression/synthesis, HypA  25.18 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0949511  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>