50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0662 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0662  TGS domain-containing protein  100 
 
 		 357 aa  720    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00027327  normal  0.0103543 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0194  TGS domain protein  59.38 
 
 		 351 aa  441  1e-123  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0982  TGS domain-containing protein  39.74 
 
 		 380 aa  249  4e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.741056 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0581  TGS domain-containing protein  42.6 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0678  TGS domain-containing protein  40.94 
 
 		 377 aa  243  3e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1844  TGS domain-containing protein  40.97 
 
 		 389 aa  238  8e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1670  TGS domain-containing protein  41.03 
 
 		 387 aa  223  6e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00970961 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0697  TGS domain-containing protein  41.07 
 
 		 387 aa  216  4e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  32.61 
 
 		 324 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1842  TGS domain protein  31.4 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.2616  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0638  small GTP-binding protein  29.92 
 
 		 328 aa  133  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1762  GTP-binding protein HSR1-related  30.58 
 
 		 330 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  28.81 
 
 		 369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.42 
 
 		 370 aa  127  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0191  TGS domain-containing protein  29.14 
 
 		 329 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230896 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2526  TGS domain-containing protein  28.3 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00530169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  26.39 
 
 		 363 aa  122  7e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  27.76 
 
 		 370 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  27.58 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  26.54 
 
 		 370 aa  120  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1848  small GTP-binding protein  27.91 
 
 		 371 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  27.86 
 
 		 371 aa  119  7.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  28.93 
 
 		 370 aa  116  6e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  29.49 
 
 		 368 aa  115  7.999999999999999e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  27.95 
 
 		 369 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  28.06 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  27.18 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  26.68 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  27.67 
 
 		 369 aa  109  6e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1559  TGS domain-containing protein  30.77 
 
 		 311 aa  109  7.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.397282  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  27.67 
 
 		 369 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0093  TGS domain-containing protein  30.36 
 
 		 346 aa  108  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0617741  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03250  cytoplasm protein, putative  26.27 
 
 		 367 aa  107  4e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.594558  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  28.22 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  24.1 
 
 		 364 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29231  predicted protein  29.01 
 
 		 374 aa  103  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35696  predicted protein  26.22 
 
 		 410 aa  97.4  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  27.4 
 
 		 368 aa  97.1  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  26.81 
 
 		 368 aa  95.1  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50671  predicted protein  26.2 
 
 		 407 aa  94.4  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  27.61 
 
 		 367 aa  93.2  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0958  small GTP-binding protein  27.24 
 
 		 365 aa  91.7  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81735  predicted protein  27.05 
 
 		 367 aa  90.9  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51277  predicted protein  25.75 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2114  GTP-binding protein, HSR1-related  46.59 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04080  GTP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05560)  25.82 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.256152 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1725  translation-associated GTPase  35.11 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0175  translation-associated GTPase  34.04 
 
 		 390 aa  47.4  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.278003  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1073  translation-associated GTPase  31.91 
 
 		 394 aa  46.2  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1959  translation-associated GTPase  31.91 
 
 		 395 aa  44.3  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>