More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2737 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2737  Argininosuccinate lyase  100 
 
 
487 aa  979    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2463  fumarate lyase  60.5 
 
 
480 aa  503  1e-141  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.610473  normal  0.30369 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3308  argininosuccinate lyase  28.27 
 
 
502 aa  228  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.69763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3258  argininosuccinate lyase  28.27 
 
 
502 aa  224  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3252  argininosuccinate lyase  29.36 
 
 
502 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0272341  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3557  argininosuccinate lyase  29.36 
 
 
502 aa  223  9e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000176741 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1660  argininosuccinate lyase  29.82 
 
 
502 aa  221  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000033744 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3657  argininosuccinate lyase  29.82 
 
 
502 aa  221  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3343  argininosuccinate lyase  28.27 
 
 
502 aa  217  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3604  argininosuccinate lyase  28.27 
 
 
502 aa  217  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0284703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3567  argininosuccinate lyase  28.27 
 
 
502 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2482  argininosuccinate lyase  32.53 
 
 
504 aa  207  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.199461  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2224  argininosuccinate lyase  30.25 
 
 
502 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.432614  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2584  argininosuccinate lyase  31.7 
 
 
496 aa  200  5e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0126458  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3564  argininosuccinate lyase  33.11 
 
 
323 aa  188  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0004  argininosuccinate lyase  29.66 
 
 
491 aa  188  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  32.15 
 
 
462 aa  176  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2490  argininosuccinate lyase  31.62 
 
 
466 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0852  argininosuccinate lyase  31.32 
 
 
492 aa  172  9e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00169507  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1295  argininosuccinate lyase  28.27 
 
 
504 aa  171  2e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.220763  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  30.7 
 
 
460 aa  171  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  33.74 
 
 
460 aa  171  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2754  argininosuccinate lyase  31.22 
 
 
467 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  32.28 
 
 
463 aa  170  6e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  32.52 
 
 
467 aa  170  6e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  32.43 
 
 
478 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1901  argininosuccinate lyase  32.63 
 
 
460 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1168  argininosuccinate lyase  27.97 
 
 
487 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0960  argininosuccinate lyase  26.93 
 
 
459 aa  167  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0731187  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0979  argininosuccinate lyase  26.93 
 
 
459 aa  167  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.248554  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  31.52 
 
 
468 aa  166  5.9999999999999996e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0180  argininosuccinate lyase  27.69 
 
 
471 aa  166  9e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  31 
 
 
491 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  31.62 
 
 
464 aa  165  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  32.88 
 
 
455 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1484  argininosuccinate lyase  28.54 
 
 
460 aa  166  1.0000000000000001e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.209695  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4386  argininosuccinate lyase  30.51 
 
 
499 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  31.7 
 
 
459 aa  164  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1520  argininosuccinate lyase  28.16 
 
 
466 aa  164  4.0000000000000004e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  30.43 
 
 
456 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0123  argininosuccinate lyase  29.81 
 
 
459 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.001821  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2173  argininosuccinate lyase  31.98 
 
 
471 aa  163  7e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0522  argininosuccinate lyase  30.03 
 
 
467 aa  163  8.000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2476  argininosuccinate lyase  30.66 
 
 
490 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0695  argininosuccinate lyase  30.51 
 
 
470 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  29.68 
 
 
461 aa  161  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  30.95 
 
 
465 aa  161  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0865  argininosuccinate lyase  30.41 
 
 
489 aa  161  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348748  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2577  argininosuccinate lyase  31.98 
 
 
471 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.400333 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  28.47 
 
 
459 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2342  argininosuccinate lyase  30.41 
 
 
469 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146568  normal  0.209916 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1219  argininosuccinate lyase  30.41 
 
 
490 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935194  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4499  argininosuccinate lyase  29.27 
 
 
457 aa  160  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.512894  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  29.23 
 
 
469 aa  160  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0048  argininosuccinate lyase  32.45 
 
 
460 aa  160  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00040  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  28.23 
 
 
624 aa  160  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2991  argininosuccinate lyase  30.41 
 
 
469 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0718  argininosuccinate lyase  30.41 
 
 
469 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1608  argininosuccinate lyase  30.41 
 
 
469 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2295  argininosuccinate lyase  30.41 
 
 
469 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1067  argininosuccinate lyase  30.41 
 
 
469 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447898  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 
468 aa  160  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  30.62 
 
 
464 aa  160  6e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  29.43 
 
 
461 aa  160  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  32.11 
 
 
476 aa  160  7e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5760  argininosuccinate lyase  29.95 
 
 
469 aa  159  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0864  argininosuccinate lyase  30.24 
 
 
469 aa  159  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0238931  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0576  argininosuccinate lyase  29.2 
 
 
492 aa  159  9e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000000512851  decreased coverage  0.000219195 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2700  argininosuccinate lyase  33.09 
 
 
478 aa  159  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  27.49 
 
 
462 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  26.95 
 
 
462 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  27.49 
 
 
463 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  27.49 
 
 
462 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  31.43 
 
 
465 aa  159  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002315  argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  28.47 
 
 
624 aa  159  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.784515  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1061  argininosuccinate lyase  30.41 
 
 
469 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1009  argininosuccinate lyase  27.69 
 
 
460 aa  158  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0621733  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3714  argininosuccinate lyase  29.06 
 
 
462 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.564837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3660  argininosuccinate lyase  29.06 
 
 
462 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1299  argininosuccinate lyase  31.64 
 
 
463 aa  158  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000094319  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2889  argininosuccinate lyase  30.05 
 
 
462 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438761 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  32.27 
 
 
466 aa  158  2e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3415  argininosuccinate lyase  31.33 
 
 
468 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2751  argininosuccinate lyase  29.78 
 
 
469 aa  159  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1818  argininosuccinate lyase  29.93 
 
 
469 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2429  argininosuccinate lyase  29.93 
 
 
469 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03845  argininosuccinate lyase  29.11 
 
 
457 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4026  argininosuccinate lyase  29.11 
 
 
457 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03794  hypothetical protein  29.11 
 
 
457 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4056  argininosuccinate lyase  29.11 
 
 
457 aa  157  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.52602 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  27.49 
 
 
462 aa  158  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4194  argininosuccinate lyase  29.11 
 
 
457 aa  157  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0548  argininosuccinate lyase  26.88 
 
 
463 aa  157  4e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4446  argininosuccinate lyase  29.11 
 
 
457 aa  157  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  27.49 
 
 
462 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00121  argininosuccinate lyase  31.54 
 
 
470 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2677  argininosuccinate lyase  30.3 
 
 
469 aa  157  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0770  argininosuccinate lyase  36.82 
 
 
497 aa  157  4e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  27.49 
 
 
462 aa  157  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1791  argininosuccinate lyase  27.52 
 
 
461 aa  157  4e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>