29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0670 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0670  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  503  1e-141  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1076  hypothetical protein  63.77 
 
 		 230 aa  275  4e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0875  hypothetical protein  44.64 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.978348 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4026  hypothetical protein  38.39 
 
 		 257 aa  105  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.452989  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3497  hypothetical protein  37.91 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.798864 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3530  hypothetical protein  36.79 
 
 		 258 aa  93.2  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475769  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0824  hypothetical protein  33.49 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0348  hypothetical protein  33.17 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2749  hypothetical protein  27.63 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.594508  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4168  hypothetical protein  35.87 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106721 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94311  predicted protein  29.02 
 
 		 406 aa  62.8  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.320101 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0870  hypothetical protein  25.93 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.706129  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0434  hypothetical protein  27.71 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1141  hypothetical protein  31.29 
 
 		 272 aa  57  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.27984  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0580  tetratricopeptide domain-containing protein  26.47 
 
 		 231 aa  52.8  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.367595  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0275  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 		 245 aa  48.9  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00217035  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0933  hypothetical protein  31.29 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2252  hypothetical protein  32.3 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.303114  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 847 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.01 
 
 		 274 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3832  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 		 211 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.172551 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6234  hypothetical protein  26.35 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 		 593 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.38 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187348  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 		 615 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 		 909 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 878 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 274 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>