29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6247 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6247  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  264  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.69241 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3397  Polyketide cyclase/dehydrase  43.85 
 
 		 245 aa  96.7  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5444  cyclase/dehydrase  39.5 
 
 		 164 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252579  normal  0.482853 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4497  cyclase/dehydrase  35.94 
 
 		 232 aa  84.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3684  cyclase/dehydrase  36.97 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1350  cyclase/dehydrase  33.06 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5344  cyclase/dehydrase  34.68 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0042  cyclase/dehydrase  35.94 
 
 		 244 aa  74.7  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.64456 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1111  cyclase/dehydrase  32.43 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3216  cyclase/dehydrase  32.43 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0978  cyclase/dehydrase  34.23 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0994  cyclase/dehydrase  34.17 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3009  cyclase/dehydrase  30.77 
 
 		 256 aa  71.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149284 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0577  cyclase/dehydrase  31.5 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0167  cyclase/dehydrase  34.09 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0123  cyclase/dehydrase  31.97 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.764786 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0834  cyclase/dehydrase  28.68 
 
 		 269 aa  63.5  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.179759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3666  cyclase/dehydrase  32.09 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0140  cyclase/dehydrase  30.33 
 
 		 242 aa  62  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0066  cyclase/dehydrase  33.03 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.364974  normal  0.163087 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1407  cyclase/dehydrase  30.36 
 
 		 197 aa  57  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0307  cyclase/dehydrase  26.79 
 
 		 303 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0114  cyclase/dehydrase  31.19 
 
 		 225 aa  51.6  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3103  hypothetical protein  33.96 
 
 		 212 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3664  hypothetical protein  33.02 
 
 		 214 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.321126 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3832  cyclase/dehydrase  33.02 
 
 		 212 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.341531 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01881  putative integral membrane protein  30.51 
 
 		 150 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.560201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2623  cyclase/dehydrase  24.32 
 
 		 244 aa  40.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.502552 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1483  putative integral membrane protein  34.69 
 
 		 150 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.77346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>