35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1185 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1185  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  278  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3709  hypothetical protein  32.41 
 
 		 255 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  52.38 
 
 		 665 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  50 
 
 		 1366 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0725  chromosome segregation ATPases-like  52.5 
 
 		 668 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.124276  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  51.28 
 
 		 1476 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  52.63 
 
 		 1247 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  54.55 
 
 		 1632 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  54.55 
 
 		 1806 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2306  glycosyl transferase group 1  54.55 
 
 		 461 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  48.72 
 
 		 756 aa  44.7  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  48.72 
 
 		 597 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  43.59 
 
 		 1067 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  46.34 
 
 		 849 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  40.48 
 
 		 746 aa  44.3  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  41.03 
 
 		 678 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  48.65 
 
 		 2342 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  52.78 
 
 		 227 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  46.15 
 
 		 535 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  48.65 
 
 		 2342 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  47.22 
 
 		 916 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  52.63 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  46.34 
 
 		 995 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  51.52 
 
 		 2796 aa  41.6  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1193  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  50 
 
 		 505 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3867  hypothetical protein  43.9 
 
 		 296 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.293011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 		 857 aa  41.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4000  hypothetical protein  33.01 
 
 		 399 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  46.15 
 
 		 1059 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  46.15 
 
 		 1035 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3984  hypothetical protein  42.86 
 
 		 644 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2403  glycosyl transferase, group 1  32.94 
 
 		 828 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1212  hypothetical protein  45.95 
 
 		 305 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.760628 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  45 
 
 		 1334 aa  40  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>