247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5142 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_5142  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
553 aa  1148    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4665  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.13 
 
 
542 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.527607  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9116  molybdopterin biosynthesis protein  33.54 
 
 
293 aa  86.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1372  hypothetical protein  24.66 
 
 
589 aa  82  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.438786  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2212  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  22.46 
 
 
576 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368882  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.07 
 
 
580 aa  75.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.329813  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0134  ThiF family protein  27.2 
 
 
594 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2344  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.52 
 
 
591 aa  68.6  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3693  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.57 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.797149  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3121  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.4 
 
 
604 aa  65.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.28 
 
 
635 aa  65.1  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.152848  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6934  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.92 
 
 
596 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.4 
 
 
604 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2022  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  26.92 
 
 
386 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3268  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.27 
 
 
280 aa  62.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0130  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.2 
 
 
257 aa  60.8  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  23.41 
 
 
387 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2929  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.19 
 
 
604 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.94961  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0279  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.39 
 
 
273 aa  58.9  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266697  normal  0.0271151 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1710  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  25.58 
 
 
379 aa  57.8  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1394  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.86 
 
 
278 aa  57  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0356  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.32 
 
 
771 aa  57  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.952881  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0806  dinucleotide-utilizing enzyme  23.7 
 
 
269 aa  56.6  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0887502  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2264  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.47 
 
 
258 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.927293  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.25 
 
 
443 aa  56.2  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.47369 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  25.61 
 
 
480 aa  55.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0560  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  28.85 
 
 
254 aa  55.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.4 
 
 
383 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1265  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25 
 
 
287 aa  55.1  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4354  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.76 
 
 
575 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0777  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  22.41 
 
 
245 aa  54.3  0.000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1931  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  26.83 
 
 
249 aa  54.7  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.477198  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0728  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25 
 
 
247 aa  54.7  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3235  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.73 
 
 
591 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.814108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3185  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.73 
 
 
591 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2127  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.54 
 
 
258 aa  54.3  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  24.17 
 
 
368 aa  54.3  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3173  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  24.73 
 
 
494 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  24.17 
 
 
368 aa  54.3  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1588  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.79 
 
 
259 aa  53.9  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.475165  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1774  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  24.58 
 
 
386 aa  53.9  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26 
 
 
383 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0813  hypothetical protein  39.19 
 
 
236 aa  53.9  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000136128  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3220  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.54 
 
 
285 aa  53.9  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0421  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.29 
 
 
270 aa  53.9  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.130311 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0742  ThiF family protein  30.3 
 
 
285 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.441652  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0777  thiamine biosynthesis protein ThiF  26.27 
 
 
207 aa  52.4  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.21058 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0597  molybdopterin biosynthesis protein  22.83 
 
 
349 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.348969  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1246  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.31 
 
 
371 aa  52.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000103579  normal  0.557515 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1499  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  22.34 
 
 
250 aa  52.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039426  normal  0.0112948 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06320  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  29.21 
 
 
554 aa  52.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2002  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.31 
 
 
268 aa  52.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0047  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  25.97 
 
 
255 aa  52.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1693  HesA/MoeB/ThiF family protein  27.42 
 
 
249 aa  52  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.658136 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.6 
 
 
390 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0127  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  23.08 
 
 
256 aa  52  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2437  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.98 
 
 
306 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.164708  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2321  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.98 
 
 
306 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.58316  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19350  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  31.03 
 
 
451 aa  52  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.274703  normal  0.0196057 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3226  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.09 
 
 
246 aa  52  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000441041  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  26.26 
 
 
380 aa  51.6  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.92 
 
 
395 aa  52  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1924  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.41 
 
 
303 aa  52  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2816  molybdopterin synthase sulfurylase MoeB  25.93 
 
 
249 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100308  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1149  thiamine biosynthesis protein ThiF  32.58 
 
 
265 aa  51.6  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000110097  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2522  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  25.93 
 
 
249 aa  51.2  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0252  molybdopterin and thiamine biosynthesis protein  36 
 
 
272 aa  51.2  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1940  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.86 
 
 
356 aa  51.2  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.124053  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1816  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.09 
 
 
364 aa  51.2  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.26 
 
 
706 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00326971  normal  0.0839405 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1702  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.18 
 
 
264 aa  50.8  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00338443  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3578  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.99 
 
 
456 aa  50.8  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1667  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  23.42 
 
 
598 aa  50.8  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.767649  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0513  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  22.43 
 
 
348 aa  50.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0795436 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2171  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  23.27 
 
 
255 aa  50.4  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.500707  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1855  thiamine biosynthesis protein ThiF  27.73 
 
 
199 aa  50.4  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1940  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.51 
 
 
262 aa  50.4  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.333296 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1620  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.52 
 
 
266 aa  50.4  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.407651 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0792  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.46 
 
 
300 aa  50.4  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0515  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.26 
 
 
286 aa  50.1  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.632456  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.66 
 
 
330 aa  50.4  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1350  thiF family protein  22.99 
 
 
264 aa  50.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.09 
 
 
254 aa  50.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251146  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3176  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.64 
 
 
257 aa  50.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1632  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.28 
 
 
275 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal  0.0862863 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1141  rhodanese-like  23.19 
 
 
381 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1633  thiamine biosynthesis protein ThiF  24.14 
 
 
203 aa  49.7  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0611  thiamine biosynthesis protein ThiF  25.16 
 
 
268 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000802075  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4770  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  25.41 
 
 
256 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1970  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  21.53 
 
 
269 aa  49.7  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014844  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  24.49 
 
 
390 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  23.81 
 
 
390 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13900  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  34.52 
 
 
550 aa  49.7  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000483  molybdopterin biosynthesis protein B  25 
 
 
249 aa  50.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.937598  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.6 
 
 
403 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0722  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.46 
 
 
300 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  23.94 
 
 
383 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  22.46 
 
 
348 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0655249  normal  0.413698 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1936  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  26.47 
 
 
407 aa  49.3  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1572  thiamine biosynthesis protein ThiF  27.73 
 
 
199 aa  49.3  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.109403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>