132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_06320 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3173  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  72.58 
 
 
494 aa  677    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06320  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  100 
 
 
554 aa  1115    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3235  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  70.11 
 
 
591 aa  755    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.814108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3185  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  70.11 
 
 
591 aa  755    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2054  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.62 
 
 
601 aa  526  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000790139 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0663  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.31 
 
 
463 aa  157  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00852937  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1667  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.37 
 
 
598 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.767649  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2929  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.51 
 
 
604 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.94961  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.82 
 
 
604 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3121  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.14 
 
 
604 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0777  thiamine biosynthesis protein ThiF  41.86 
 
 
207 aa  59.3  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.21058 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1702  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.12 
 
 
264 aa  58.9  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00338443  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2212  thiF family protein  33.63 
 
 
272 aa  57  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0356  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.09 
 
 
771 aa  57.4  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.952881  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2985  thiamine biosynthesis adenylyltransferase ThiF  33.66 
 
 
282 aa  55.5  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.35 
 
 
246 aa  53.9  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0656  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  39.02 
 
 
255 aa  53.9  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1138  thiamine biosynthesis protein ThiF  42.5 
 
 
213 aa  53.5  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.119618 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1633  thiamine biosynthesis protein ThiF  41.03 
 
 
203 aa  52.8  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5142  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.21 
 
 
553 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1107  adenylyltransferase thiF  34.02 
 
 
260 aa  52  0.00003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0852  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.84 
 
 
261 aa  52  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2450  adenylyltransferase ThiF  34.38 
 
 
258 aa  51.6  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0885  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  33.33 
 
 
260 aa  51.6  0.00004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0512  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.96 
 
 
268 aa  51.6  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3925  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.69 
 
 
377 aa  51.2  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.384403  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0890  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.9 
 
 
273 aa  50.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0371  thiamine biosynthesis protein ThiF  29.31 
 
 
203 aa  50.8  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4077  ThiF family protein  33.63 
 
 
266 aa  50.8  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1499  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.45 
 
 
250 aa  50.4  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039426  normal  0.0112948 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0568  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.42 
 
 
243 aa  50.4  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3926  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.85 
 
 
364 aa  50.4  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.396526  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0790  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  37.86 
 
 
339 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02663  hypothetical protein  33.63 
 
 
268 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0876  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.63 
 
 
268 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3182  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.74 
 
 
277 aa  48.9  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  38.14 
 
 
263 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5993  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.43 
 
 
586 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02624  hypothetical protein  33.63 
 
 
268 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0387  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.63 
 
 
372 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.628178  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0560  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  26.62 
 
 
254 aa  49.3  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2956  ThiF family protein  33.63 
 
 
268 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00132  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3118  ThiF family protein  33.63 
 
 
268 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00141325  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0900  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.63 
 
 
268 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0515  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.37 
 
 
286 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.632456  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00144  Thiamine biosynthesis protein ThiF  34.04 
 
 
233 aa  48.9  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0798  thiamine biosynthesis protein ThiF  41.43 
 
 
206 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.97 
 
 
254 aa  48.9  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251146  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3654  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.36 
 
 
318 aa  48.5  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.71 
 
 
249 aa  48.5  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.458318  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4459  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.05 
 
 
259 aa  48.5  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000135994 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3220  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.52 
 
 
285 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.39 
 
 
251 aa  48.5  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0652  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  39.39 
 
 
251 aa  48.5  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.522282  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4541  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  37.86 
 
 
339 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.43862 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1681  HesA/MoeB/ThiF family protein  34.62 
 
 
296 aa  48.1  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0134  ThiF family protein  28.72 
 
 
594 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3578  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.98 
 
 
456 aa  47.8  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2953  ThiF family protein  32.74 
 
 
266 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0973303  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3058  ThiF family protein  33.63 
 
 
268 aa  47.8  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0969752  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0522  HesA/MoeB/ThiF family protein  26.9 
 
 
267 aa  47.8  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.94 
 
 
580 aa  47.4  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.329813  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0112  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.78 
 
 
216 aa  47.4  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.157166  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2571  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.5 
 
 
243 aa  47.4  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.508745  normal  0.0248599 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2344  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.37 
 
 
591 aa  47  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0742  ThiF family protein  30.89 
 
 
285 aa  47.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.441652  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0073  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.38 
 
 
264 aa  47  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000480961  normal  0.411412 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold-containing protein  33.96 
 
 
302 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1855  thiamine biosynthesis protein ThiF  33.33 
 
 
199 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0728  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.28 
 
 
247 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0996  thiF family protein  38.16 
 
 
275 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0511396  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1439  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.2 
 
 
239 aa  46.6  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6934  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.09 
 
 
596 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3213  ThiF family protein  34.83 
 
 
268 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3199  ThiF family protein  32.74 
 
 
268 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3150  ThiF family protein  34.02 
 
 
268 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3133  ThiF family protein  32.74 
 
 
268 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.852277  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3313  ThiF family protein  34.83 
 
 
268 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.223246  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0774  hypothetical protein  30.2 
 
 
300 aa  45.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  decreased coverage  0.00314195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1525  ThiF family protein  33.33 
 
 
276 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3014  HesA/MoeB/thiF family protein  33.33 
 
 
252 aa  46.2  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017357  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1283  thiamine biosynthesis protein ThiF family protein  36.56 
 
 
243 aa  46.2  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.49 
 
 
253 aa  46.2  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594436  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0542  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  36.71 
 
 
264 aa  46.2  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0546  HesA/MoeB/ThiF family protein  39.13 
 
 
277 aa  45.8  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0491251  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0362  adenylyl transferase  28.81 
 
 
250 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0620  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  36 
 
 
339 aa  45.8  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3305  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.3 
 
 
274 aa  46.2  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1572  thiamine biosynthesis protein ThiF  33.33 
 
 
199 aa  45.4  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.109403  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4482  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.89 
 
 
592 aa  45.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.21 
 
 
706 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00326971  normal  0.0839405 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3224  hypothetical protein  38.16 
 
 
275 aa  45.4  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  normal  0.551633 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1048  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.16 
 
 
275 aa  45.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0446  thiF protein  32.73 
 
 
235 aa  45.1  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0750126 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2443  thiF protein, putative  38.96 
 
 
300 aa  45.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0113  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  27.16 
 
 
255 aa  44.7  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0792  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.35 
 
 
300 aa  44.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0589  hypothetical protein  33 
 
 
236 aa  45.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0970373  hitchhiker  0.000644128 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.62 
 
 
244 aa  44.7  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2065  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  25.54 
 
 
427 aa  45.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.86041  normal  0.202815 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>