187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3173 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3173  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  100 
 
 
494 aa  992    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3235  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  99.8 
 
 
591 aa  990    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.814108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3185  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  99.8 
 
 
591 aa  990    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06320  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  72.58 
 
 
554 aa  678    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2054  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.4 
 
 
601 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000790139 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0663  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.38 
 
 
463 aa  110  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00852937  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.82 
 
 
604 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3121  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.25 
 
 
604 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2929  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.59 
 
 
604 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.94961  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1667  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.56 
 
 
598 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.767649  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1702  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.41 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00338443  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0656  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  39.6 
 
 
255 aa  58.9  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1855  thiamine biosynthesis protein ThiF  36.59 
 
 
199 aa  58.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1138  thiamine biosynthesis protein ThiF  45 
 
 
213 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.119618 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3213  ThiF family protein  31.34 
 
 
268 aa  57.4  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3313  ThiF family protein  31.34 
 
 
268 aa  57.4  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.223246  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0356  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.08 
 
 
771 aa  57  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.952881  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1681  HesA/MoeB/ThiF family protein  29.29 
 
 
296 aa  56.2  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1572  thiamine biosynthesis protein ThiF  35.77 
 
 
199 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.109403  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3150  ThiF family protein  30.6 
 
 
268 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0852  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.35 
 
 
261 aa  55.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.53 
 
 
244 aa  55.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0777  thiamine biosynthesis protein ThiF  43.08 
 
 
207 aa  55.8  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.21058 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2212  thiF family protein  32.04 
 
 
272 aa  55.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3133  ThiF family protein  30.6 
 
 
268 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.852277  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0560  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.62 
 
 
254 aa  55.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3199  ThiF family protein  30.6 
 
 
268 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5142  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.73 
 
 
553 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0742  ThiF family protein  31.97 
 
 
285 aa  54.3  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.441652  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0512  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.71 
 
 
268 aa  54.3  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0902  HesA/MoeB/ThiF family protein  31.54 
 
 
288 aa  54.3  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0515  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.4 
 
 
286 aa  54.3  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.632456  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3578  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.19 
 
 
456 aa  53.9  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0360  HesA/MoeB/ThiF family protein  31.97 
 
 
288 aa  53.9  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00356091  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0660  HesA/MoeB/ThiF family protein  31.97 
 
 
288 aa  53.9  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0996044  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2495  HesA/MoeB/ThiF family protein  31.97 
 
 
288 aa  53.9  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1313  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0905  HesA/MoeB/ThiF family protein  31.97 
 
 
288 aa  53.9  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.386795  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0108  HesA/MoeB/ThiF family protein  31.97 
 
 
288 aa  53.9  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00087346  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4459  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.62 
 
 
259 aa  53.9  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000135994 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3220  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.15 
 
 
285 aa  53.9  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1283  thiamine biosynthesis protein ThiF family protein  37.76 
 
 
243 aa  52.8  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1062  HesA/MoeB/ThiF family protein  31.97 
 
 
341 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41 
 
 
251 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0652  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  41 
 
 
251 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.522282  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0718  HesA/MoeB/ThiF family protein  31.15 
 
 
288 aa  52.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0036619  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0890  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35 
 
 
273 aa  53.5  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2985  thiamine biosynthesis adenylyltransferase ThiF  34.95 
 
 
282 aa  53.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1275  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.95 
 
 
291 aa  52.4  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1525  ThiF family protein  33.64 
 
 
276 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3058  ThiF family protein  31.62 
 
 
268 aa  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0969752  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0371  thiamine biosynthesis protein ThiF  31.9 
 
 
203 aa  52.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.14 
 
 
253 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594436  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0611  thiamine biosynthesis protein ThiF  34.34 
 
 
268 aa  52.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000802075  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5899  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.15 
 
 
285 aa  52.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2953  ThiF family protein  31.62 
 
 
266 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0973303  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.39 
 
 
249 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.458318  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3809  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.33 
 
 
268 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000533838  hitchhiker  0.000000527658 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4077  ThiF family protein  31.62 
 
 
266 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02663  hypothetical protein  31.62 
 
 
268 aa  52  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0876  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.62 
 
 
268 aa  52  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0900  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.62 
 
 
268 aa  52  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2591  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.15 
 
 
285 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1682  thiamine biosynthesis protein ThiF  29.53 
 
 
207 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000522342  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1956  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.15 
 
 
285 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3958  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2567  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.15 
 
 
285 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450041  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02624  hypothetical protein  31.62 
 
 
268 aa  52  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3118  ThiF family protein  31.62 
 
 
268 aa  52  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00141325  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2956  ThiF family protein  31.62 
 
 
268 aa  52  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00132  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0546  HesA/MoeB/ThiF family protein  33.33 
 
 
277 aa  51.2  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0491251  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1633  thiamine biosynthesis protein ThiF  43.59 
 
 
203 aa  51.2  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0790  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  38.1 
 
 
339 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2615  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.15 
 
 
285 aa  50.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3925  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32 
 
 
377 aa  50.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.384403  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0996  thiF family protein  29.51 
 
 
275 aa  50.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0511396  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0885  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  32.29 
 
 
260 aa  50.4  0.00007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3305  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.5 
 
 
274 aa  50.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0112  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.9 
 
 
216 aa  50.1  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.157166  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold-containing protein  35.42 
 
 
302 aa  50.4  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.68 
 
 
246 aa  50.1  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1158  thiamine biosynthesis protein ThiF  26.15 
 
 
201 aa  50.1  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00601178  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2486  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.15 
 
 
285 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.184998 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1190  thiamine biosynthesis protein ThiF  32.22 
 
 
267 aa  49.7  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2513  thiamine biosynthesis protein ThiF  32.17 
 
 
219 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000693793  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1107  adenylyltransferase thiF  31.96 
 
 
260 aa  49.7  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0279  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.67 
 
 
273 aa  49.7  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266697  normal  0.0271151 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0729  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.15 
 
 
285 aa  50.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4541  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  38.1 
 
 
339 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.43862 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2450  adenylyltransferase ThiF  33.04 
 
 
258 aa  49.7  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3926  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.18 
 
 
364 aa  49.3  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.396526  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000483  molybdopterin biosynthesis protein B  29.71 
 
 
249 aa  48.9  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.937598  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3224  hypothetical protein  29.51 
 
 
275 aa  48.9  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  normal  0.551633 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0542  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.45 
 
 
264 aa  49.3  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1149  thiamine biosynthesis protein ThiF  38.24 
 
 
265 aa  49.3  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000110097  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0798  thiamine biosynthesis protein ThiF  42.86 
 
 
206 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1067  thiamine biosynthesis protein ThiF  33.33 
 
 
267 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.451189  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0188  hypothetical protein  36.73 
 
 
252 aa  48.9  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430925  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0191  ThiF family protein  31.33 
 
 
307 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0568  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.4 
 
 
243 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0620  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  35.92 
 
 
339 aa  48.9  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0735  thiamine biosynthesis protein ThiF  32.22 
 
 
267 aa  48.9  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>