130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4305 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4305  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  100 
 
 		 412 aa  787    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0499711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3848  acyl-CoA dehydrogenase type 2  80.33 
 
 		 391 aa  523  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.680066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4157  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  79.78 
 
 		 391 aa  520  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0737881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0138  cyclic nucleotide-binding protein  60.98 
 
 		 382 aa  363  4e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363055  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3329  acyl-CoA dehydrogenase type 2  59.26 
 
 		 382 aa  359  5e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3593  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.85 
 
 		 385 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4098  acyl-CoA dehydrogenase  41.28 
 
 		 373 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.461592  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0796  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  44.38 
 
 		 381 aa  236  8e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585612  normal  0.628725 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0575  Acyl-CoA dehydrogenase  41.69 
 
 		 322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2922  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  37.33 
 
 		 391 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3131  hypothetical protein  33.44 
 
 		 337 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470644  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2998  hypothetical protein  33.44 
 
 		 337 aa  110  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5871  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  32.64 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.845489  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2543  hypothetical protein  32.03 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3259  acyl-CoA dehydrogenase-related protein  31.14 
 
 		 347 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.543921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2502  hypothetical protein  30.45 
 
 		 347 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5416  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  32.9 
 
 		 388 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2636  acyl-CoA dehydrogenase  30.95 
 
 		 347 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292935  normal  0.528602 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2567  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  33.33 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.752192  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2652  acyl-CoA dehydrogenase  30.48 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.685897 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2240  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  32.51 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2027  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  30.07 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1346  hypothetical protein  29.66 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0806475  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0202  hypothetical protein  30.13 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.499323  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1866  acyl-CoA dehydrogenase-related protein  22.41 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0335  hypothetical protein  30.13 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0512  hypothetical protein  28.72 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0189199  decreased coverage  0.000000311595 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0063  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  24.72 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1801  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  22.77 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.162926 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2310  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.79 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.154104  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2352  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.79 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657423  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2538  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.86 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.844573  decreased coverage  0.00557828 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1168  putative acyl-coa dehydrogenase  22.99 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1175  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11010  acyl-CoA dehydrogenase  25.96 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6601  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  25.7 
 
 		 425 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0223249  normal  0.275726 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0955  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25.07 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1952  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.89 
 
 		 387 aa  54.3  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5014  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30 
 
 		 384 aa  54.3  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0555  hypothetical protein  31.19 
 
 		 350 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0021  dehydrogenase  35.61 
 
 		 313 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0755375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  27.62 
 
 		 448 aa  53.9  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0249  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.51 
 
 		 383 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.538468  normal  0.417839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4334  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.72 
 
 		 409 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5156  acyl-CoA dehydrogenase  25.22 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0718281  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08210  butyryl-CoA dehydrogenase  23.75 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.249284 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1308  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.57 
 
 		 407 aa  51.2  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0239  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.26 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2163  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.52 
 
 		 395 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.893753  normal  0.219871 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0319  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.79 
 
 		 383 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.339666  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4988  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.06 
 
 		 413 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4937  acyl-CoA dehydrogenase-related protein  26.57 
 
 		 334 aa  50.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3488  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  27.9 
 
 		 411 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3551  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.9 
 
 		 411 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3501  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.9 
 
 		 411 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102842  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0894  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.94 
 
 		 396 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0403335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4265  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.27 
 
 		 387 aa  50.1  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.184931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0146  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain-containing protein  26.72 
 
 		 382 aa  49.7  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1183  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  24.15 
 
 		 390 aa  49.7  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1361  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.91 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.237176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3260  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.42 
 
 		 459 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31100  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  31.94 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.88 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1128  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.17 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4695  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.2 
 
 		 387 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.46169  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2670  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25.6 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1754  Acyl-CoA dehydrogenase  28.69 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0688656 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1842  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.18 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.982054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0248  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.93 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3403  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.37 
 
 		 409 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0408106  normal  0.104533 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5837  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  24.93 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0226  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.56 
 
 		 388 aa  47.8  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.597403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2547  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  22.67 
 
 		 392 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0224  DszC family monooxygenase  25.59 
 
 		 413 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1390  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.18 
 
 		 384 aa  47  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00428618  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34200  putative FMNH2-dependent monooxygenase  26.51 
 
 		 394 aa  47  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.911533  normal  0.0321853 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6564  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  27.48 
 
 		 402 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.82838  normal  0.227478 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0150  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27 
 
 		 394 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2772  monooxygenase, putative  23.37 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01080  hypothetical protein  29.67 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1247  putative monooxygenase  23.18 
 
 		 394 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.791276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0888  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  28.5 
 
 		 396 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  27.09 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.5 
 
 		 396 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2981  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.37 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0478  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.85 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.859047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3604  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  26.7 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.339437 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0240  Acyl-CoA dehydrogenase-like  25 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31350  DszC-like desulfurization enzyme  27.35 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5139  putative acyl-CoA dehydrogenase  27.22 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2907  putative FMNH2-dependent monooxygenase  26.22 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486418  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43890  Acyl-CoA dehydrogenase-related protein  23.46 
 
 		 395 aa  45.8  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3342  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.25 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4154  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.57 
 
 		 440 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.233252 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2151  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.92 
 
 		 383 aa  44.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54630  acyl-CoA dehydrogenase  30.14 
 
 		 387 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169112 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0557  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.45 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3917  Acyl-CoA dehydrogenase-like  22.28 
 
 		 395 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2419  Acyl-CoA dehydrogenase  27.59 
 
 		 332 aa  44.3  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.238624  normal  0.291589 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1359  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.86 
 
 		 381 aa  44.3  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0903405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>