More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4218 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4218  amidohydrolase  100 
 
 
466 aa  928    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39910  metal dependent hydrolase  53.47 
 
 
520 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.776901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4435  amidohydrolase  36.94 
 
 
451 aa  236  8e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7586  hypothetical protein  36.48 
 
 
456 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5508  hypothetical protein  35.9 
 
 
451 aa  222  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5157  amidohydrolase  34.76 
 
 
487 aa  196  7e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4067  amidohydrolase  34.81 
 
 
461 aa  193  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.737174  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0206  hypothetical protein  30.7 
 
 
466 aa  169  9e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6231  hypothetical protein  33.41 
 
 
445 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.425385  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8698  amidohydrolase  35.16 
 
 
428 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1042  hypothetical protein  30.82 
 
 
451 aa  155  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289988  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4132  hypothetical protein  32.58 
 
 
451 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1224  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.48 
 
 
441 aa  139  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1199  amidohydrolase  25.56 
 
 
431 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.242168  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.89 
 
 
432 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0048  amidohydrolase  28.66 
 
 
501 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3755  amidohydrolase  32.16 
 
 
419 aa  131  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1785  hypothetical protein  30.54 
 
 
459 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211733  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2899  amidohydrolase  35.88 
 
 
482 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  25.59 
 
 
433 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01530  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  29.49 
 
 
452 aa  126  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.904881  normal  0.929171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4731  amidohydrolase  30.17 
 
 
490 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.01 
 
 
434 aa  124  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0911  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.35 
 
 
442 aa  125  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  29.21 
 
 
656 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3049  amidohydrolase  32.47 
 
 
414 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.22 
 
 
445 aa  124  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.356182 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  27.93 
 
 
439 aa  123  7e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1611  amidohydrolase  28.68 
 
 
445 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170905  decreased coverage  0.00285374 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  24.67 
 
 
434 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1336  amidohydrolase  30.82 
 
 
451 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395151 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2471  amidohydrolase  28.89 
 
 
480 aa  121  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.356182  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2167  amidohydrolase  26.48 
 
 
436 aa  120  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1947  amidohydrolase  29 
 
 
466 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.442808  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  28.1 
 
 
440 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  26.82 
 
 
431 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2025  amidohydrolase  30 
 
 
504 aa  116  8.999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0702  chlorohydrolase family protein  27.65 
 
 
455 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  30.37 
 
 
663 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  28.57 
 
 
428 aa  116  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  27.09 
 
 
442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  26.32 
 
 
440 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11770  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  25.33 
 
 
449 aa  113  6e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf580  cytosine deaminase  23.2 
 
 
435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.239245  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1229  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.88 
 
 
444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.42003e-16  normal  0.25554 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  25.77 
 
 
434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4181  amidohydrolase  29.75 
 
 
663 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.748776  unclonable  0.000000000471707 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  28.93 
 
 
430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0947  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.98 
 
 
441 aa  109  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1531  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.63 
 
 
439 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  23.32 
 
 
431 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2834  amidohydrolase  27.06 
 
 
451 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3649  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.11 
 
 
443 aa  108  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1959  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.74 
 
 
444 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2283  amidohydrolase  29.82 
 
 
473 aa  107  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  27.96 
 
 
444 aa  106  7e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  25.6 
 
 
447 aa  106  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2226  amidohydrolase  27.67 
 
 
433 aa  106  9e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.306812 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2379  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  31.83 
 
 
476 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750758  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2526  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  31.83 
 
 
476 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262801  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2404  amidohydrolase  27.13 
 
 
432 aa  106  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.378859  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2422  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  31.83 
 
 
500 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15770  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.5 
 
 
445 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1294  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28 
 
 
493 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  22.62 
 
 
432 aa  105  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3139  amidohydrolase  25.79 
 
 
461 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2773  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.07 
 
 
446 aa  104  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.04 
 
 
439 aa  104  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2073  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.53 
 
 
470 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722851  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0260  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.61 
 
 
453 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  25.23 
 
 
440 aa  103  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0574  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.91 
 
 
441 aa  103  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1743  hydrolase, Atz/Trz family  27.84 
 
 
443 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3238  amidohydrolase  26.27 
 
 
444 aa  103  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  24.94 
 
 
426 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  21.75 
 
 
428 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23240  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.21 
 
 
444 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00576591 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3916  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.09 
 
 
447 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33045  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4080  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.12 
 
 
444 aa  101  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.55583  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2038  amidohydrolase  23.49 
 
 
422 aa  101  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984083  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.27 
 
 
469 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1506  amidohydrolase  29.29 
 
 
445 aa  100  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.111511  normal  0.058245 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00380  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.55 
 
 
449 aa  100  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.280018  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1707  amidohydrolase  28.61 
 
 
431 aa  100  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000668627  normal  0.0323622 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1486  amidohydrolase  27.61 
 
 
435 aa  99.8  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0059  amidohydrolase  29.02 
 
 
448 aa  99.8  9e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.312881  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2741  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.77 
 
 
454 aa  99.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03194  conserved hypothetical protein  25.65 
 
 
464 aa  99  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.78 
 
 
465 aa  99  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4866  amidohydrolase  25.5 
 
 
660 aa  99  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1577  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.6 
 
 
455 aa  97.4  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0236916  unclonable  0.000000239085 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1846  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.81 
 
 
439 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190979  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1931  amidohydrolase  26.58 
 
 
440 aa  97.1  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.64184  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1728  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  22.98 
 
 
452 aa  96.7  8e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  26.05 
 
 
431 aa  96.7  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2187  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.01 
 
 
448 aa  96.7  8e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147574  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.57 
 
 
484 aa  96.7  8e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3081  amidohydrolase  27.45 
 
 
464 aa  96.3  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2323  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.07 
 
 
465 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.57 
 
 
451 aa  96.3  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>