26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2783 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2783  Abortive infection protein  100 
 
 		 275 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal  0.142133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2888  Abortive infection protein  86.18 
 
 		 272 aa  380  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2661  abortive infection protein  86.18 
 
 		 272 aa  381  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.612389 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4524  abortive infection protein  50.18 
 
 		 285 aa  201  8e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.516167 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1092  abortive infection protein  51.09 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0698  Abortive infection protein  43.61 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.577597  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  43.02 
 
 		 420 aa  57  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1232  CAAX amino terminal protease family protein  34.29 
 
 		 333 aa  57  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020685 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2005  abortive infection protein  33.68 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0944847  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2280  abortive infection protein  32.63 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1848  metal-dependent membrane protease  39.56 
 
 		 448 aa  52.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05731  membrane-associated protease  39.56 
 
 		 448 aa  52.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  41.18 
 
 		 420 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05181  membrane-associated protease  40.23 
 
 		 453 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  32.18 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  37.93 
 
 		 319 aa  45.8  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4723  CAAX family protease  32.29 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.998962 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03479  caax amino terminal protease family  35.42 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  31.58 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  34.12 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  35 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5416  Abortive infection protein  33.04 
 
 		 345 aa  43.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  37.65 
 
 		 775 aa  42.7  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1880  abortive infection protein  31.96 
 
 		 279 aa  42.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  36.78 
 
 		 267 aa  42.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0142  abortive infection protein  33.7 
 
 		 210 aa  42.4  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0827934 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>