25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2515 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2515  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  100 
 
 
395 aa  781    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.991601 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4043  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  71.07 
 
 
394 aa  509  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0336  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  49.49 
 
 
394 aa  352  5.9999999999999994e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2512  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  50.63 
 
 
393 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.731479 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3293  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  42.61 
 
 
406 aa  285  9e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4040  hypothetical protein  45.64 
 
 
395 aa  277  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5922  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004305  sugar kinases ribokinase family  39.07 
 
 
413 aa  258  9e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0333  hypothetical protein  39.02 
 
 
387 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.616988 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0203  hypothetical protein  36.25 
 
 
358 aa  166  6.9999999999999995e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3641  pfkB family carbohydrate kinase  29.92 
 
 
442 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1600  PfkB family carbohydrate kinase  31.66 
 
 
445 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.744108 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1923  Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  37.23 
 
 
142 aa  54.7  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1182  purine deoxyribosyltransferase  36.61 
 
 
147 aa  53.5  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0969  purine deoxyribosyltransferase  30.36 
 
 
147 aa  53.1  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0548717  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1343  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.63 
 
 
142 aa  52.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2574  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  39.58 
 
 
156 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000346796  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0433  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase superfamily protein  27.78 
 
 
182 aa  50.4  0.00005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.485819  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5342  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.28 
 
 
143 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2452  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.42 
 
 
297 aa  47  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14861  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.65 
 
 
155 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0740611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2000  hypothetical protein  32.32 
 
 
140 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0878  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  37.5 
 
 
144 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0444  purine deoxyribosyltransferase  29.36 
 
 
146 aa  44.3  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0570339  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1524  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  37.74 
 
 
176 aa  43.9  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274327  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1703  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  43.1  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0242104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>