17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1799 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1799  hypothetical protein  100 
 
 
653 aa  1285    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1798  hypothetical protein  73.96 
 
 
682 aa  659    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1813  hypothetical protein  68.52 
 
 
670 aa  552  1e-156  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.543185  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  46.1 
 
 
848 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  45.14 
 
 
787 aa  239  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1809  nitroreductase  48.78 
 
 
344 aa  232  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1815  nitroreductase  45.12 
 
 
349 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  46.44 
 
 
2554 aa  221  5e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  42.63 
 
 
1732 aa  204  5e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  43.15 
 
 
3295 aa  203  9e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0250  nitroreductase  38.35 
 
 
320 aa  195  2e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.554213  normal  0.110242 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  45.58 
 
 
361 aa  193  7e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1785  nitroreductase  40.61 
 
 
276 aa  171  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1811  hypothetical protein  35.04 
 
 
272 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237705  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0251  hypothetical protein  30.04 
 
 
298 aa  102  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.16959  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0738  hypothetical protein  43.15 
 
 
627 aa  92.8  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.140724  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1803  hypothetical protein  32.77 
 
 
248 aa  57.8  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>