34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1748 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1748  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  100 
 
 		 68 aa  129  9e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0834  transcription factor CBF/NF-Y histone  88.24 
 
 		 68 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.687128  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1071  transcription factor CBF/NF-Y histone  83.58 
 
 		 68 aa  110  8.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.741766 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0919  transcription factor CBF/NF-Y histone  86.76 
 
 		 68 aa  103  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0365  transcription factor CBF/NF-Y histone  76.47 
 
 		 68 aa  100  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204552  normal  0.073064 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0165  transcription factor CBF/NF-Y histone  71.21 
 
 		 69 aa  94.7  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0494  histone  72.73 
 
 		 67 aa  90.5  7e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.957808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2458  transcription factor CBF/NF-Y histone  65.15 
 
 		 69 aa  89  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.87612 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0576  transcription factor CBF/NF-Y histone  62.12 
 
 		 69 aa  87  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0168926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1384  transcription factor CBF/NF-Y histone  54.55 
 
 		 67 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0524  transcription factor CBF/NF-Y/histone domain-containing protein  54.55 
 
 		 67 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1252  histone  54.55 
 
 		 67 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.372378  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1373  transcription factor CBF/NF-Y histone  54.55 
 
 		 67 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.295317  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1921  transcription factor CBF/NF-Y histone  53.73 
 
 		 69 aa  68.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1305  transcription factor CBF/NF-Y histone  50 
 
 		 67 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.905778  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1375  histone  50 
 
 		 73 aa  60.8  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.712978  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0231  histone  50 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0592  transcription factor CBF/NF-Y histone  50 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0853808  normal  0.113464 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1326  transcription factor CBF/NF-Y/histone domain-containing protein  50 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0950819  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0658  transcription factor CBF/NF-Y histone  48.48 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1584  histone  42.62 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0659  transcription factor CBF/NF-Y histone  42.42 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000216135  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1432  transcription factor CBF/NF-Y/histone domain-containing protein  44.62 
 
 		 78 aa  51.2  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1704  transcription factor CBF/NF-Y histone  43.55 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.356758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0023  transcription factor  43.94 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2248  Histone core domain protein  43.94 
 
 		 146 aa  42.7  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.771026  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0416  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  42.62 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0348  transcription factor CBF/NF-Y histone  33.87 
 
 		 86 aa  42  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00540  hypothetical protein  38.89 
 
 		 152 aa  42  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.288962  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90527  predicted protein  38.46 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73330  predicted protein  38.46 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.136215  normal  0.357299 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0110  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  40.98 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.835787 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00733  Histone H3 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P23753]  38.46 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.013922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69601  predicted protein  38.46 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0806469  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>