More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8545 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8545  transposase and inactivated derivative  100 
 
 
73 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1109  transposase and inactivated derivative  63.77 
 
 
122 aa  103  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.194071  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4245  transposase and inactivated derivative  63.77 
 
 
122 aa  103  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1125  transposase and inactivated derivative  64.06 
 
 
117 aa  98.2  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135223 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  56.16 
 
 
253 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9115  transposase protein  56.16 
 
 
125 aa  95.5  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4714  IS298, transposase OrfA  57.35 
 
 
117 aa  95.5  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2632  IS298, transposase OrfA  57.35 
 
 
117 aa  95.5  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0421919  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4382  IS298, transposase OrfA  57.35 
 
 
117 aa  95.5  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490773  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4301  IS298, transposase OrfA  57.35 
 
 
117 aa  95.5  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.496479  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4666  IS298, transposase OrfA  57.35 
 
 
117 aa  95.5  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159074  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2618  IS298, transposase OrfA  57.35 
 
 
117 aa  95.5  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.197321 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  57.53 
 
 
255 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  54.79 
 
 
253 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  54.79 
 
 
253 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  54.79 
 
 
253 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  54.79 
 
 
253 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5016  hypothetical protein  60.56 
 
 
124 aa  94  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0903137 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2122  IS298, transposase OrfA  57.53 
 
 
110 aa  92.8  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0549  hypothetical protein  54.79 
 
 
125 aa  93.2  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2704  transposase and inactivated derivative  54.93 
 
 
122 aa  93.2  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.905782  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1222  transposase and inactivated derivative  54.93 
 
 
122 aa  93.2  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362267  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7507  putative transposase  56.16 
 
 
122 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0100  hypothetical protein  53.62 
 
 
115 aa  90.9  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0046  IS298, transposase OrfA  58.9 
 
 
126 aa  90.5  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0771  hypothetical protein  54.41 
 
 
111 aa  89.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2018  IS298, transposase OrfA  58.9 
 
 
133 aa  90.1  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2649  IS298, transposase OrfA  58.9 
 
 
133 aa  90.1  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3519  putative transposase  55.22 
 
 
251 aa  87.8  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343195  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0007  transposase  50.68 
 
 
132 aa  87  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272336  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0181  transposase  50.68 
 
 
132 aa  87  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65132  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0972  transposase  50.68 
 
 
132 aa  87  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1283  transposase  50.68 
 
 
132 aa  87  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.2132  normal  0.263939 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1591  transposase  50.68 
 
 
132 aa  87  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.602434 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2474  transposase  50.68 
 
 
132 aa  87  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2499  transposase  50.68 
 
 
132 aa  87  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.71476  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2823  transposase  50.68 
 
 
132 aa  87  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2862  transposase  50.68 
 
 
132 aa  87  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3014  transposase  50.68 
 
 
132 aa  87  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3038  transposase  50.68 
 
 
132 aa  87  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3115  transposase  50.68 
 
 
132 aa  87  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0735642  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1289  transposase  50.68 
 
 
124 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2925  transposase  50.68 
 
 
124 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1378  putative transposase  52.94 
 
 
157 aa  85.1  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.16406  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2626  putative transposase  52.94 
 
 
93 aa  85.1  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00808856  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2701  putative transposase  52.94 
 
 
93 aa  85.1  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.14179 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2835  hypothetical protein  51.47 
 
 
92 aa  82  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1322  transposase  52.94 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2931  transposase  52.05 
 
 
157 aa  82  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30036  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4170  transposase  46.58 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1754  transposase  48.61 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.356095  normal  0.53027 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11060  transposase  46.38 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.869155 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0214  transposase  53.57 
 
 
106 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0077  transposase  43.84 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  45.59 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4819  transposase (putative)  46.38 
 
 
109 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0564  hypothetical protein  41.67 
 
 
90 aa  68.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4008  putative IS1648 transposase  44.12 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  42.47 
 
 
260 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  42.47 
 
 
260 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  41.89 
 
 
123 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13900  transposase  48.53 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.707887  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20970  transposase  48.53 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  41.89 
 
 
123 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  41.89 
 
 
123 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  41.89 
 
 
123 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  41.89 
 
 
123 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  42.47 
 
 
273 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  42.47 
 
 
260 aa  67.4  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2953  hypothetical protein  41.1 
 
 
149 aa  67  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21790  transposase  43.84 
 
 
135 aa  67  0.00000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.406801  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14940  transposase  43.84 
 
 
129 aa  67  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0421984  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14830  transposase  43.84 
 
 
129 aa  67  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.227198  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06550  transposase  43.84 
 
 
129 aa  67  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.244138  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14740  transposase  43.84 
 
 
129 aa  67  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421882  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15010  transposase  43.84 
 
 
129 aa  67  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.658905  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23130  transposase  43.84 
 
 
129 aa  67  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  42.47 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  42.47 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  42.47 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4250  putative transposase  50 
 
 
66 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750496  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4670  hypothetical protein  45.21 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46128  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06530  transposase  42.47 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4190  hypothetical protein  43.48 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4226  hypothetical protein  43.48 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02000  transposase  42.47 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0292  putative transposase  40 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.4660800000000001e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  38.24 
 
 
251 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1808  hypothetical protein  51.79 
 
 
94 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1102  putative transposase  41.33 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.334321 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  38.24 
 
 
158 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  42.47 
 
 
266 aa  63.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  44.29 
 
 
303 aa  63.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  44.29 
 
 
303 aa  63.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.33 
 
 
281 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  44.29 
 
 
303 aa  63.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  36 
 
 
260 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  36 
 
 
260 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36 
 
 
281 aa  62.8  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  36 
 
 
260 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>