39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8234 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8234  HNH endonuclease  100 
 
 		 151 aa  309  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0543214  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1844  HNH endonuclease  45.04 
 
 		 178 aa  101  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1305  HNH endonuclease  42.53 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.500836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2705  gp65  33.72 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.271328  normal  0.759343 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0656  gp65  32.56 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0844  HNH endonuclease  49.18 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2598  HNH endonuclease  38.16 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1374  gp65  31.76 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0798155 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3594  HNH endonuclease  30.59 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2634  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.017055  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3512  phage-like protein  33.8 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.88204  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  38.67 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3433  HNH endonuclease  35.38 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0175216  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2062  HNH endonuclease  33.77 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0218324  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2025  HNH endonuclease  33.77 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0654  HNH endonuclease  36.59 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0212  HNH nuclease  36.84 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.307481  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1652  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  44.07 
 
 		 471 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2609  phage related protein  34.21 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3431  Gp54 protein  33.85 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0094955  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3540  HNH endonuclease  32.18 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0122  HNH endonuclease  40 
 
 		 427 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3808  prophage LambdaBa02, HNH endonuclease family protein  41.67 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0621  HNH endonuclease  36.71 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4096  prophage LambdaBa02, HNH endonuclease family protein  41.67 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3410  HNH endonuclease domain protein  47.54 
 
 		 422 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0057  HNH endonuclease  41.18 
 
 		 427 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 459 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 459 aa  41.6  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1893  HNH endonuclease domain protein  45.9 
 
 		 435 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2125  Type III restriction enzyme, res subunit  42.62 
 
 		 842 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0845  HNH endonuclease  39.06 
 
 		 240 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  41.94 
 
 		 560 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0440  prophage LambdaBa04, Gp54  30.99 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.8645  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0461  prophage lambdaba04, gp54  30.99 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0379  hypothetical protein  45.24 
 
 		 221 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5242  RNA-directed DNA polymerase  34.92 
 
 		 587 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.461209  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4075  HNH endonuclease  41.38 
 
 		 459 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>