19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6218 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6218  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  535  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7027  hypothetical protein  91.67 
 
 
264 aa  467  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1062  hypothetical protein  43.72 
 
 
234 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.734655  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6204  hypothetical protein  42.42 
 
 
202 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0914  hypothetical protein  42.55 
 
 
236 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.226558 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2001  hypothetical protein  41.41 
 
 
205 aa  135  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1332  hypothetical protein  42.11 
 
 
202 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0191735  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0515  hypothetical protein  37.63 
 
 
201 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.356354  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0243  hypothetical protein  37.57 
 
 
204 aa  105  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5673  hypothetical protein  38.25 
 
 
237 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1277  hypothetical protein  35.98 
 
 
227 aa  92  8e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.136895  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6478  hypothetical protein  32.61 
 
 
311 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0261  hypothetical protein  35.68 
 
 
239 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1223  hypothetical protein  35.29 
 
 
227 aa  90.9  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00168849  normal  0.293183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4051  hypothetical protein  32.55 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  32.95 
 
 
989 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2943  protein of unknown function DUF847  80 
 
 
107 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94317  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2175  chitinase  40.79 
 
 
431 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000288646  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  32.87 
 
 
190 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>