More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0808 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0808  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  100 
 
 		 327 aa  652    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0359  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  79.51 
 
 		 327 aa  531  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000624901 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1526  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  77.68 
 
 		 327 aa  523  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5289  quinone oxidoreductase  76.07 
 
 		 327 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574483  normal  0.60541 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4744  alcohol dehydrogenase  75.46 
 
 		 327 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5461  zinc-binding alcohol dehydrogenase  75.77 
 
 		 327 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5401  alcohol dehydrogenase  75.77 
 
 		 327 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910947 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0250  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  74.23 
 
 		 327 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.68401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3356  quinone oxidoreductase  74.85 
 
 		 327 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0638936 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4869  quinone oxidoreductase  75.15 
 
 		 327 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.578327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1185  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  72.17 
 
 		 327 aa  479  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1602  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  70.34 
 
 		 327 aa  478  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2939  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  69.72 
 
 		 327 aa  471  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2962  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  71.17 
 
 		 327 aa  471  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2819  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  70.64 
 
 		 327 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3408  alcohol dehydrogenase  67.69 
 
 		 327 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2753  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  67.9 
 
 		 327 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.700456  normal  0.0252326 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1643  zinc-binding alcohol dehydrogenase  69.11 
 
 		 327 aa  463  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.561484  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2968  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  66.67 
 
 		 327 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0338214  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3700  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  68.5 
 
 		 327 aa  455  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24770  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  71.04 
 
 		 328 aa  453  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0728  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  68.42 
 
 		 325 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.43463 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1984  alcohol dehydrogenase  66.36 
 
 		 327 aa  449  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18460  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  65.34 
 
 		 327 aa  447  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0766  alcohol dehydrogenase  65.44 
 
 		 327 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1474  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  64.51 
 
 		 331 aa  441  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0065  alcohol dehydrogenase  67.38 
 
 		 326 aa  441  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1434  putative Zn-dependent oxidoreductase  66.15 
 
 		 326 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2634  zinc-binding alcohol dehydrogenase  66.46 
 
 		 325 aa  436  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0082  alcohol dehydrogenase  66.77 
 
 		 326 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0838693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2639  zinc-binding alcohol dehydrogenase  63.08 
 
 		 345 aa  432  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.718234  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0752  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  64 
 
 		 330 aa  427  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2365  quinone oxidoreductase  65.23 
 
 		 328 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1675  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  67.9 
 
 		 327 aa  428  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.509844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1204  quinone oxidoreductase  63.8 
 
 		 326 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.740135  normal  0.265781 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1230  zinc-binding alcohol dehydrogenase  64.51 
 
 		 328 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4477  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  62.27 
 
 		 327 aa  426  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000206096 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2229  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  67.9 
 
 		 327 aa  422  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.979693 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1108  alcohol dehydrogenase  63.58 
 
 		 328 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.588532  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2517  putative zinc-binding dehydrogenase  65.94 
 
 		 326 aa  419  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.145021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2846  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  63.08 
 
 		 328 aa  420  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0354021  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3133  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  63.99 
 
 		 338 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.87638 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1586  alcohol dehydrogenase  63.38 
 
 		 330 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3502  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  62.65 
 
 		 328 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.990659  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2891  putative oxidoreductase protein  63.39 
 
 		 338 aa  413  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5139  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  62.15 
 
 		 328 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2767  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  63.39 
 
 		 338 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4337  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  62.96 
 
 		 329 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270219  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4748  oxidoreductase, zinc-binding  57.8 
 
 		 327 aa  410  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4779  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  63.19 
 
 		 325 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.279047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1210  alcohol dehydrogenase  63.8 
 
 		 328 aa  408  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783737  normal  0.219465 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1893  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  63.19 
 
 		 327 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6206  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  61.85 
 
 		 328 aa  401  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3034  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  62.24 
 
 		 334 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1248  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  64.31 
 
 		 328 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.893092  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3189  zinc-binding alcohol dehydrogenase  61.93 
 
 		 333 aa  401  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0612  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  63.69 
 
 		 329 aa  404  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00543509 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1223  quinone oxidoreductase  61.89 
 
 		 328 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3679  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  60 
 
 		 329 aa  403  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3835  quinone oxidoreductase  62.04 
 
 		 328 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2364  dehydrogenase NAD(P)-binding domain-containing protein  60.92 
 
 		 328 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.214717 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0309  zinc-binding alcohol dehydrogenase  60 
 
 		 328 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0105  zinc-binding alcohol dehydrogenase  60.62 
 
 		 328 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227745  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2477  acyl-CoA dehydrogenase-like  63.38 
 
 		 738 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193974  normal  0.0198771 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4991  alcohol dehydrogenase  60.43 
 
 		 328 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0950  quinone oxidoreductase  57.85 
 
 		 327 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.759216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0901  alcohol dehydrogenase  60.24 
 
 		 327 aa  389  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1052  quinone oxidoreductase  58.54 
 
 		 327 aa  387  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4187  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  59.88 
 
 		 332 aa  385  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4334  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  59.38 
 
 		 334 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3877  quinone oxidoreductase  59.57 
 
 		 332 aa  383  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161114  normal  0.0453412 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2475  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  58.59 
 
 		 329 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2363  alcohol dehydrogenase  58.15 
 
 		 329 aa  372  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.949479  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0249  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  57.23 
 
 		 325 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0608751  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3519  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  56.75 
 
 		 330 aa  368  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.231356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0260  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  56.92 
 
 		 325 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03112  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  56.92 
 
 		 324 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0728423  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0454  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  56.92 
 
 		 324 aa  366  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.749607  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0463  quinone oxidoreductase  54.63 
 
 		 325 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.152247  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0454  quinone oxidoreductase  56.62 
 
 		 324 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0396  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family protein  54.63 
 
 		 325 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4569  quinone oxidoreductase, YhdH family  56.62 
 
 		 324 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000284525  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3737  quinone oxidoreductase  56.62 
 
 		 324 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296751  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3443  quinone oxidoreductase  56.62 
 
 		 324 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378871  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3548  quinone oxidoreductase  56.31 
 
 		 324 aa  365  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000395647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03063  hypothetical protein  56.92 
 
 		 324 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0710671  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1035  alcohol dehydrogenase  56.44 
 
 		 326 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3285  quinone oxidoreductase, YhdH family  56.31 
 
 		 324 aa  364  1e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00682496  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0178  YhdH/YhfP family quinone oxidoreductase  57.85 
 
 		 326 aa  363  2e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000873043  normal  0.604397 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1200  putative quinone oxidoreductase  54.32 
 
 		 325 aa  363  2e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal  0.0860145 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3837  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  58.33 
 
 		 328 aa  363  3e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00134301  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3679  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  55.08 
 
 		 326 aa  361  7.0000000000000005e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0862676  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001990  alcohol dehydrogenase  54.29 
 
 		 326 aa  361  9e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2493  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56.44 
 
 		 326 aa  361  1e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00458  alcohol dehydrogenase  53.37 
 
 		 326 aa  356  2.9999999999999997e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3346  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  56.21 
 
 		 328 aa  355  3.9999999999999996e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.584462  normal  0.149022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4413  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  55.56 
 
 		 325 aa  355  5e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00493012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0467  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  55.38 
 
 		 325 aa  354  1e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3639  hypothetical protein  54.15 
 
 		 324 aa  352  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000530088 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3674  hypothetical protein  54.63 
 
 		 324 aa  352  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0677066  normal  0.330413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>