28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3131 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3131  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  281  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437849  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1820  hypothetical protein  70.15 
 
 
136 aa  201  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.394206  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3272  hypothetical protein  69.77 
 
 
133 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4457  hypothetical protein  67.97 
 
 
132 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00222547 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0933  hypothetical protein  67.19 
 
 
132 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0997  hypothetical protein  67.19 
 
 
132 aa  184  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.954295  hitchhiker  0.000000182894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0894  hypothetical protein  66.41 
 
 
132 aa  184  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2926  hypothetical protein  60.9 
 
 
141 aa  175  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3560  hypothetical protein  59.68 
 
 
131 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549553  normal  0.183463 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03632  hypothetical protein  54.55 
 
 
139 aa  157  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2875  hypothetical protein  54.2 
 
 
133 aa  157  7e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.191047  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1042  hypothetical protein  56.59 
 
 
141 aa  154  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.141033  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0596  hypothetical protein  55.04 
 
 
132 aa  153  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2128  hypothetical protein  55.73 
 
 
133 aa  152  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2281  hypothetical protein  53.49 
 
 
134 aa  149  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0629  hypothetical protein  52.71 
 
 
133 aa  147  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91146  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3341  protein of unknown function DUF1486  48.06 
 
 
134 aa  136  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188642  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0997  hypothetical protein  45.86 
 
 
135 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000466996  unclonable  8.0025e-19 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5423  hypothetical protein  49.18 
 
 
134 aa  131  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2071  hypothetical protein  39.83 
 
 
138 aa  86.3  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2218  hypothetical protein  32.76 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.341322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1610  protein of unknown function DUF1486  28.79 
 
 
146 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.692563  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1179  protein of unknown function DUF1486  27.82 
 
 
153 aa  50.4  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  25.74 
 
 
137 aa  44.3  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2768  hypothetical protein  32.39 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4466  hypothetical protein  26.61 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.545567  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2759  hypothetical protein  24.03 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1595  hypothetical protein  25.37 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000510897  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>