25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2249 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2249  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 
183 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2892  hypothetical protein  37.32 
 
 
211 aa  64.3  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0147927  normal  0.668761 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0878  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.91 
 
 
266 aa  58.2  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.605473  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1510  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.59 
 
 
307 aa  48.5  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360333  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.74 
 
 
1261 aa  47  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4678  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.21 
 
 
75 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3627  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.74 
 
 
309 aa  45.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000535955  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6789  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.28 
 
 
1554 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.9 
 
 
487 aa  45.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3594  antifreeze protein, type I  45.31 
 
 
178 aa  45.1  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.742366  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3279  antifreeze protein, type I  45.31 
 
 
178 aa  45.1  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.51996 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0371  lytic murein transglycosylase  43.4 
 
 
390 aa  44.7  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804364  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0535  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.74 
 
 
1072 aa  43.9  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3878  hypothetical protein  47.92 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  41.51 
 
 
486 aa  43.9  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4203  lytic murein transglycosylase  38.89 
 
 
458 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2632  peptidoglycan binding domain-containing protein  45 
 
 
116 aa  44.3  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3935  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.18 
 
 
522 aa  43.5  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.45551  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4055  lytic murein transglycosylase  36.84 
 
 
462 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4881  lytic murein transglycosylase  31.65 
 
 
442 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1408  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.93 
 
 
478 aa  42.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2694  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.36 
 
 
315 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4311  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.3 
 
 
305 aa  42  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3399  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.78 
 
 
251 aa  42  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  46.15 
 
 
239 aa  41.6  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>