18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3935 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3935  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 522 aa  1015    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.45551  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4588  hypothetical protein  29.87 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0813033  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0171  protein of unknown function DUF1236  33.33 
 
 		 244 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0235303  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4684  hypothetical protein  36.36 
 
 		 217 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160013  normal  0.998354 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2945  hypothetical protein  31.03 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2434  hypothetical protein  28.26 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.293675 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5149  protein of unknown function DUF1236  36.36 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.108864  normal  0.0926669 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6931  protein of unknown function DUF1236  31.91 
 
 		 292 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0115074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2716  protein of unknown function DUF1236  30.47 
 
 		 223 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5226  protein of unknown function DUF1236  39.06 
 
 		 62 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.400383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  37.31 
 
 		 239 aa  50.8  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3573  lytic murein transglycosylase  45.45 
 
 		 381 aa  49.7  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  decreased coverage  0.00457991 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4145  hypothetical protein  26.76 
 
 		 229 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5403  hypothetical protein  26.84 
 
 		 466 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2866  hypothetical protein  31.63 
 
 		 219 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1807  protein of unknown function DUF1236  29.41 
 
 		 245 aa  46.6  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.856316 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.51 
 
 		 391 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  46.15 
 
 		 457 aa  43.5  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>