32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5574 on replicon NC_008147
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1466  hypothetical protein  45.65 
 
 		 858 aa  655    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.467243  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5574  hypothetical protein  100 
 
 		 844 aa  1691    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4461  hypothetical protein  46.36 
 
 		 858 aa  676    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5977  hypothetical protein  100 
 
 		 844 aa  1691    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1489  hypothetical protein  45.65 
 
 		 858 aa  655    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2521  hypothetical protein  37.5 
 
 		 869 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.828375 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0748  hypothetical protein  34.74 
 
 		 855 aa  464  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.298605  normal  0.440798 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3821  hypothetical protein  35.39 
 
 		 870 aa  444  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0310113 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0098  hypothetical protein  34.12 
 
 		 872 aa  399  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2658  hypothetical protein  32.27 
 
 		 839 aa  303  7.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000653199  hitchhiker  0.00786959 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5900  hypothetical protein  31.07 
 
 		 792 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3110  hypothetical protein  31.85 
 
 		 611 aa  206  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.464764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3322  S8A family peptidase  24.62 
 
 		 795 aa  84.3  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.546962  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3504  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.82 
 
 		 827 aa  70.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.227841  normal  0.192563 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0448  hypothetical protein  26.29 
 
 		 712 aa  67  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5328  hypothetical protein  25.11 
 
 		 829 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355422  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3864  hypothetical protein  24.01 
 
 		 847 aa  60.8  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000004588 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1641  Subtilisin-like serine protease protein  25.7 
 
 		 570 aa  59.3  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1586  hypothetical protein  24.01 
 
 		 847 aa  58.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2107  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25.45 
 
 		 760 aa  56.6  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.817284  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3111  hypothetical protein  30.64 
 
 		 169 aa  55.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5724  hypothetical protein  41.03 
 
 		 152 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2253  subtilisin-like serine protease  27.5 
 
 		 823 aa  54.3  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0512  hypothetical protein  31.47 
 
 		 835 aa  53.9  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0576205  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0085  hypothetical protein  24.8 
 
 		 849 aa  53.5  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0321951  normal  0.899584 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4146  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.58 
 
 		 729 aa  52  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370543 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1292  hypothetical protein  23.74 
 
 		 841 aa  52.4  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886595 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3535  hypothetical protein  22.48 
 
 		 850 aa  48.9  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.692569  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2639  hypothetical protein  20.86 
 
 		 821 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0443804  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3739  hypothetical protein  22.18 
 
 		 740 aa  47.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3853  hypothetical protein  24.15 
 
 		 845 aa  47.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0523  hypothetical protein  24.44 
 
 		 743 aa  45.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>