11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3111 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3111  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  342  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0098  hypothetical protein  31.45 
 
 		 872 aa  66.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1466  hypothetical protein  27.54 
 
 		 858 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.467243  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1489  hypothetical protein  27.54 
 
 		 858 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4461  hypothetical protein  27.54 
 
 		 858 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5574  hypothetical protein  30.64 
 
 		 844 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5977  hypothetical protein  30.64 
 
 		 844 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2521  hypothetical protein  27.22 
 
 		 869 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.828375 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0748  hypothetical protein  29.53 
 
 		 855 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.298605  normal  0.440798 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3821  hypothetical protein  24.52 
 
 		 870 aa  41.6  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0310113 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5900  hypothetical protein  28.12 
 
 		 792 aa  41.2  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>