More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0206 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1301  phosphomannomutase  89.7 
 
 
437 aa  804    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0617  phosphomannomutase  92.22 
 
 
437 aa  818    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0206  phosphomannomutase  100 
 
 
437 aa  877    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.323905  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0682  phosphomannomutase  75.06 
 
 
437 aa  663    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0032  phosphomannomutase  65.9 
 
 
439 aa  597  1e-169  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.457022  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1432  Phosphomannomutase  36.73 
 
 
453 aa  285  8e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2510  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  35.04 
 
 
455 aa  280  4e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3760  Phosphomannomutase  36 
 
 
453 aa  276  7e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1768  Phosphomannomutase  34.23 
 
 
451 aa  270  5e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1134  phosphomannomutase  35.85 
 
 
472 aa  269  8e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.579862  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4298  Phosphomannomutase  33.48 
 
 
454 aa  265  8.999999999999999e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6327  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  36.09 
 
 
450 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.428689  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2432  Fis family transcriptional regulator  34.46 
 
 
444 aa  260  3e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4063  Phosphomannomutase  35.85 
 
 
456 aa  258  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0919518  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0585  Phosphomannomutase  37.05 
 
 
447 aa  256  5e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.681403  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13286  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  34.07 
 
 
465 aa  255  9e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.489635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1328  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  34.59 
 
 
465 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23364  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1345  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  34.59 
 
 
465 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0751  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  35.04 
 
 
452 aa  254  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.648752  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1364  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  34.59 
 
 
465 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.176475  normal  0.655061 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0756  Phosphomannomutase  35.16 
 
 
451 aa  251  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.0777802 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1187  Phosphomannomutase  34 
 
 
456 aa  251  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1425  phosphomannomutase  33.63 
 
 
469 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.896243  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1387  Phosphomannomutase  34.88 
 
 
450 aa  250  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0465  phosphomannomutase  34.79 
 
 
454 aa  249  6e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441417  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4694  phosphomannomutase  35.36 
 
 
446 aa  246  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4726  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  34.73 
 
 
465 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.267989  normal  0.336703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1737  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  34.36 
 
 
464 aa  246  6e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.847298  normal  0.689022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3174  Phosphomannomutase  34.29 
 
 
456 aa  246  8e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1218  phosphomannomutase  35.6 
 
 
448 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0459323  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3841  Phosphomannomutase  32.97 
 
 
497 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.062306 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0898  phosphomannomutase  32.81 
 
 
461 aa  243  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.478971  normal  0.0385997 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31020  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  33.85 
 
 
451 aa  241  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815121  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7604  Phosphomannomutase  34.74 
 
 
449 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0961  phosphomannomutase  33.41 
 
 
461 aa  237  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.386078 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4124  phosphomannomutase  34.19 
 
 
448 aa  236  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0671  phosphomannomutase  33.41 
 
 
475 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.828766  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0818  Phosphomannomutase  33.77 
 
 
472 aa  233  6e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2542  Phosphomannomutase  31.16 
 
 
488 aa  232  9e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5858  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  35.78 
 
 
453 aa  232  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03540  phosphomannomutase  30.5 
 
 
491 aa  231  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1677  phosphomannomutase  33.71 
 
 
457 aa  229  1e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6010  Phosphomannomutase  32.44 
 
 
454 aa  225  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.30884  normal  0.056179 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4168  Phosphomannomutase  34 
 
 
471 aa  223  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.400371  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08560  phosphomannomutase  32.26 
 
 
487 aa  220  3e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3151  Phosphomannomutase  33.11 
 
 
450 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3126  phosphomannomutase  32.51 
 
 
461 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141531  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1600  phosphomannomutase  32.82 
 
 
455 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0455813  normal  0.713517 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1952  phosphomannomutase  33.93 
 
 
414 aa  217  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.322718  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0362  Phosphomannomutase  32.82 
 
 
474 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2851  Phosphomannomutase  31.71 
 
 
457 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20740  phosphomannomutase  33.11 
 
 
592 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00626227  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1779  phosphomannomutase ManB  30.67 
 
 
450 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1792  phosphomannomutase  30.44 
 
 
450 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3585  Phosphomannomutase  32.06 
 
 
479 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1134  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain III  32.06 
 
 
450 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0747537  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0219  phosphomannomutase  31.87 
 
 
465 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1317  Phosphomannomutase  33.92 
 
 
457 aa  211  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214391  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3037  phosphomannomutase  34 
 
 
457 aa  211  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.848364  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2622  phosphomannomutase  34.49 
 
 
463 aa  211  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1256  phosphomannomutase  34 
 
 
457 aa  209  7e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000453708  hitchhiker  0.000000000293956 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1021  phosphomannomutase  30.26 
 
 
472 aa  209  8e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01932  Phosphomannomutase  32.16 
 
 
454 aa  208  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0083  phosphomannomutase AlgC  31.9 
 
 
465 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1118  phosphomannomutase  33.33 
 
 
454 aa  209  1e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000519382  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0895  Phosphomannomutase  32.89 
 
 
456 aa  208  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310909  hitchhiker  0.000000688858 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3178  phosphomannomutase  33.85 
 
 
457 aa  207  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0863  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  32.89 
 
 
813 aa  206  7e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1242  Phosphomannomutase  31.49 
 
 
469 aa  206  8e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1014  phosphomannomutase  31.28 
 
 
456 aa  205  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09120  phosphomannomutase  28.74 
 
 
529 aa  204  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.187509 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2255  Phosphomannomutase  31.04 
 
 
450 aa  204  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0395092  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1593  phosphomannomutase  31.06 
 
 
456 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.014113  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2964  phosphomannomutase  31.95 
 
 
456 aa  204  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000327344 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6098  phosphomannomutase AlgC  31.42 
 
 
868 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2982  phosphomannomutase  31.28 
 
 
456 aa  203  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140295 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2172  phosphomannomutase  31.76 
 
 
460 aa  202  7e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.140706  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5542  phosphomannomutase  30.62 
 
 
465 aa  202  8e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1786  phosphoglucomutase  31.65 
 
 
471 aa  202  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1001  phosphomannomutase  32.67 
 
 
453 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.834887  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2589  Phosphomannomutase  31.4 
 
 
447 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70270  phosphomannomutase AlgC  31.42 
 
 
854 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2662  phosphomannomutase  31.26 
 
 
456 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0392975  normal  0.829535 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2673  Phosphomannomutase  28.54 
 
 
464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00943387 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1609  Phosphomannomutase  30.84 
 
 
456 aa  201  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000012475  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2945  phosphomannomutase  29.37 
 
 
457 aa  201  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02910  Phosphomannomutase/phosphoglucomutase AlgC  30.11 
 
 
488 aa  201  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2643  phosphomannomutase  31.49 
 
 
457 aa  201  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320582  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2340  phosphomannomutase  30.84 
 
 
456 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1793  phosphomannomutase  31.51 
 
 
481 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302913  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1856  Phosphomannomutase  29.67 
 
 
502 aa  200  3.9999999999999996e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114337  decreased coverage  0.00605536 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01954  phosphomannomutase  30.84 
 
 
456 aa  200  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0099894  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1993  Phosphomannomutase  29.45 
 
 
459 aa  199  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00229621 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01943  hypothetical protein  30.84 
 
 
456 aa  200  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00870446  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0399  phosphomannomutase  31.65 
 
 
471 aa  200  5e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.889065  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4379  phosphomannomutase  31.64 
 
 
863 aa  199  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.124617 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3280  Phosphomannomutase  31.5 
 
 
454 aa  199  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03174  phosphohexose mutase  30.51 
 
 
448 aa  199  7e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1184  phosphomannomutase  30.62 
 
 
456 aa  199  7.999999999999999e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2337  phosphomannomutase  30.33 
 
 
456 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113042  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>