92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_11040 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_11040  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  168  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.12642  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0039  tRNA-Leu  87.8 
 
 
82 bp  83.8  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.304437  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0037  tRNA-Leu  87.8 
 
 
82 bp  83.8  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000248476 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0025  tRNA-Leu  96.67 
 
 
85 bp  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.330204  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0068  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0085  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.196786  normal  0.612491 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0016  tRNA-Leu  85.25 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.718102  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309171  tRNA-Leu  91.89 
 
 
82 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.622371  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0032  tRNA-Leu  91.89 
 
 
82 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNALeuVIMSS1309210  tRNA-Leu  91.89 
 
 
82 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309130  tRNA-Leu  91.89 
 
 
82 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309098  tRNA-Leu  91.89 
 
 
82 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0014  tRNA-Leu  91.89 
 
 
82 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309380  tRNA-Leu  91.89 
 
 
82 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0025  tRNA-Leu  96.55 
 
 
82 bp  50.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0045  tRNA-Leu  93.94 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.936664  normal  0.134818 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0184  tRNA-Leu  84.38 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0032  tRNA-Leu  93.75 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13491  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  91.43 
 
 
1263 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0057  tRNA-Leu  93.55 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0014  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0044  tRNA-Leu  96.3 
 
 
82 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.312452 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0028  tRNA-Leu  91.43 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14871  acetylornithine aminotransferase  91.43 
 
 
1254 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.387015  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17211  acetylornithine aminotransferase  91.43 
 
 
1263 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1397  acetylornithine aminotransferase  91.43 
 
 
1254 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14621  acetylornithine aminotransferase  91.43 
 
 
1254 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0051  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000584609  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2157  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00076268  hitchhiker  0.000000000132078 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2105  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000470601  hitchhiker  1.53435e-16 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0980  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000163209  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0058  tRNA-Leu  96.15 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29408  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0054  tRNA-Leu  96.15 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0462143  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0052  tRNA-Leu  96.15 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0462143  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1274  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000352128  hitchhiker  0.000541618 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1301  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000334703  hitchhiker  0.000000433032 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0077  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0377043  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0076  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0377043  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0071  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000142441  normal  0.199865 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t043  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0093  tRNA-Leu  96.15 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023989  normal  0.396382 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0046  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000111621  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00029  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000361603  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  93.33 
 
 
82 bp  44.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0057  tRNA-Leu  91.18 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0023  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  44.1  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0017  tRNA-Leu  93.33 
 
 
88 bp  44.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0014  tRNA-Leu  93.33 
 
 
84 bp  44.1  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000108759  hitchhiker  0.00000048604 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.245269  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0005  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2098  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000256224  hitchhiker  0.00730061 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t035  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t036  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0016  tRNA-Leu  96.15 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.460002  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t071  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000662467  normal  0.0211471 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2681  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000136258  normal  0.046213 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4669  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.9786200000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1178  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000100662  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0089  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000116077  normal  0.0210623 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0060  tRNA-Leu  96.15 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000996161  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0066  tRNA-Leu  96.15 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000463268  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu01  tRNA-Leu  100 
 
 
92 bp  44.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0086  tRNA-Leu  96.15 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.115514  normal  0.84209 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0084  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000101131  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0085  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000347265  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0063  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000302371  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0092  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118641  hitchhiker  0.00000124407 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0057  tRNA-Leu  96.15 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.428944  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0082  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302516  normal  0.0498089 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0081  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000027716  normal  0.0498089 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0084  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000189086  normal  0.285336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0085  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00198738  normal  0.283647 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0089  tRNA-Leu  96.15 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0189785  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0072  tRNA-Leu  96.15 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.021945  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0053  tRNA-Leu  96.15 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.741173  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0044  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000971142  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0086  tRNA-Leu  96.15 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5037  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000374172  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0098  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00669623  hitchhiker  0.0018362 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0067  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000113297  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0066  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000102831  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0061  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000343038  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0059  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.295265  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0045  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000122945  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0089  tRNA-Leu  96.15 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0049  tRNA-Leu  96.15 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000237414  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0009  tRNA-Leu  96.15 
 
 
88 bp  44.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.207835  normal  0.0298119 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0065  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239453  normal  0.915141 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0057  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000366309  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0056  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000431173  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0045  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000264513  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t01  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>