40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0446 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0446  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  313  6e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0344  PEBP family protein  31.36 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0343  PEBP family protein  28.38 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0857  PEBP family protein  34.56 
 
 
206 aa  63.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0135  YbhB and YbcL  38.75 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1321  PEBP family protein  26.32 
 
 
153 aa  61.2  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1514  PEBP family protein  29.79 
 
 
154 aa  60.5  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0212174 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2383  PEBP family protein  28.99 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2814  PBP family phospholipid-binding protein  32.11 
 
 
194 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.581391  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  28.99 
 
 
200 aa  53.9  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  28.36 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  28.99 
 
 
193 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  27.14 
 
 
176 aa  51.6  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  28.15 
 
 
181 aa  50.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0267  PEBP family protein  29.32 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368658  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1322  PEBP family protein  26.62 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  28.15 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_002936  DET0532  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  28.21 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.201907  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  26.43 
 
 
176 aa  48.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  27.27 
 
 
185 aa  47  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3483  PEBP family protein  33.73 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4067  PEBP family protein  28.91 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0923  PEBP family protein  27.59 
 
 
190 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.748073  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0945  PEBP family protein  26.49 
 
 
192 aa  45.4  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_473  phosphatidylethanolamine-binding protein  26.09 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1506  PBP family phospholipid-binding protein  30 
 
 
190 aa  45.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000587287  hitchhiker  0.0000712833 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5858  PEBP family protein  25.37 
 
 
156 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.677291 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3871  PEBP family protein  28.28 
 
 
153 aa  44.3  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1784  YbhB and YbcL  27.56 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0803  PEBP family protein  25.32 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0508  PBP family phospholipid-binding protein  24.58 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2051  PBP family phospholipid-binding protein  26.47 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16900  conserved hypothetical protein TIGR00481  27.43 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117094  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  30 
 
 
617 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0960  PEBP family protein  27.59 
 
 
190 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0174403 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00495  predicted kinase inhibitor  32.26 
 
 
183 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.325407  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00500  hypothetical protein  32.26 
 
 
183 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.269505  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  21.95 
 
 
156 aa  41.2  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  26.67 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  27.5 
 
 
155 aa  40.4  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>