17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0250 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0250  nitroreductase  100 
 
 		 320 aa  654    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.554213  normal  0.110242 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1809  nitroreductase  50.8 
 
 		 344 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1815  nitroreductase  48 
 
 		 349 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1798  hypothetical protein  41.7 
 
 		 682 aa  208  9e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  45.2 
 
 		 848 aa  202  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1813  hypothetical protein  41.31 
 
 		 670 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.543185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1799  hypothetical protein  40.23 
 
 		 653 aa  194  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  45.22 
 
 		 2554 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  42.63 
 
 		 787 aa  181  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  45.21 
 
 		 361 aa  179  4e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  39.61 
 
 		 3295 aa  178  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1785  nitroreductase  40.66 
 
 		 276 aa  170  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  41.92 
 
 		 1732 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1811  hypothetical protein  36.57 
 
 		 272 aa  140  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0251  hypothetical protein  28.44 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.16959  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0257  hypothetical protein  49.25 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.583611 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1803  hypothetical protein  39.44 
 
 		 248 aa  50.4  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>