More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5439 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009339  Mflv_5439  integrase catalytic subunit  100 
 
 
278 aa  580  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.298779  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4903  Integrase catalytic region  72.66 
 
 
277 aa  428  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4711  Integrase catalytic region  72.66 
 
 
277 aa  429  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.988899  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0603  integrase catalytic subunit  71.11 
 
 
271 aa  407  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0897  Integrase catalytic region  71.24 
 
 
442 aa  353  1e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.157158  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4475  Integrase catalytic region  54.79 
 
 
263 aa  278  6e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22000  transposase  55.08 
 
 
267 aa  277  1e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.208093 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17090  transposase  55.08 
 
 
267 aa  277  1e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200015  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08090  transposase  55.08 
 
 
267 aa  277  1e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.757215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1111  integrase catalytic subunit  43.68 
 
 
273 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.461857  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1456  integrase catalytic subunit  43.7 
 
 
345 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1693  integrase catalytic subunit  43.7 
 
 
345 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1708  integrase catalytic subunit  43.7 
 
 
345 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420426  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2595  integrase catalytic subunit  43.7 
 
 
345 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0685219  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4204  integrase catalytic subunit  43.7 
 
 
345 aa  192  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250601  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3188  integrase catalytic subunit  43.7 
 
 
345 aa  192  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.524164  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4763  integrase catalytic subunit  43.7 
 
 
345 aa  192  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307384  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4752  integrase catalytic subunit  43.7 
 
 
345 aa  192  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5655  integrase catalytic subunit  43.7 
 
 
358 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.935858  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5608  integrase catalytic subunit  43.57 
 
 
250 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120507  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1474  integrase catalytic subunit  43.57 
 
 
250 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1721  integrase catalytic subunit  43.57 
 
 
250 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1737  integrase catalytic subunit  43.57 
 
 
250 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524311  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1753  integrase catalytic subunit  43.57 
 
 
250 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344033  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5362  integrase catalytic subunit  43.57 
 
 
250 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958298  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4452  integrase catalytic subunit  43.57 
 
 
250 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2264  integrase catalytic subunit  43.57 
 
 
250 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577576  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1664  integrase catalytic subunit  43.57 
 
 
250 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183363  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1590  integrase catalytic subunit  43.57 
 
 
250 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  39.47 
 
 
307 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1567  Integrase catalytic region  39.1 
 
 
309 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2014  Integrase catalytic region  43.18 
 
 
297 aa  171  2e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  38.66 
 
 
393 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  37.84 
 
 
284 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4852  integrase catalytic region  36.68 
 
 
260 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0318827 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3415  integrase catalytic subunit  37.25 
 
 
282 aa  155  6e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  37.36 
 
 
267 aa  155  9e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_90  transposase  37.36 
 
 
267 aa  155  9e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  37.36 
 
 
271 aa  155  9e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0376  integrase catalytic region  36.58 
 
 
274 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000146675  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  37.07 
 
 
283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55060  hypothetical protein  36.54 
 
 
280 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000896639  unclonable  2.5426499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0876  integrase catalytic region  36.88 
 
 
273 aa  152  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4336  integrase catalytic region  35.11 
 
 
309 aa  152  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.139423  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4529  integrase catalytic region  35.11 
 
 
309 aa  152  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1913  putative insertion element  36.88 
 
 
273 aa  152  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000339403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0464  integrase catalytic region  36.88 
 
 
273 aa  152  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2508  integrase  36.88 
 
 
273 aa  152  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0298999 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2104  putative integrase  36.88 
 
 
273 aa  152  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.209867  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4683  integrase catalytic region  35.11 
 
 
309 aa  152  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3381  Integrase catalytic region  40.38 
 
 
278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  39.77 
 
 
278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0043  A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0377  IS407A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246103  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0464  IS407A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0629  IS407A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000121323  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0782  IS407A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1243  IS407A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1265  IS407A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.399396  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1345  IS407A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1457  IS407A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1524  A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1610  IS407A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0450  IS407A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0545  IS407A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0687  IS407A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0709  IS407A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0823  A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0938  IS407A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0452781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0999  IS407A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1196  IS407A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00667486  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1267  IS407A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1323  IS407A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1379  IS407A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1427  IS407A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1486  A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1522  A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128506  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1529  A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1560  IS407A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677585  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1647  IS407A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.265136  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1692  A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1717  A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.451919  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1740  IS407A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0828457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1751  A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.872254  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1783  IS407A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3133  IS407A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3193  IS407A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00220403  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3409  IS407A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3477  IS407A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3523  A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0008  IS407A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00464552  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0023  IS1404 transposase  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0026  IS407A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0068  IS1404 transposase  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438744  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0117  IS407A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0263  IS407A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0587266  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0301  IS1404 transposase  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0406  IS407A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.803611  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0471  IS407A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0565  IS407A, transposase OrfB  36.98 
 
 
277 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>