30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0952 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0952  beta-lactamase  100 
 
 
295 aa  595  1e-169  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.233942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5336  putative alanine rich lipoprotein LppW  70.76 
 
 
310 aa  431  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5425  putative alanine rich lipoprotein LppW  70.76 
 
 
310 aa  431  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5715  putative alanine rich lipoprotein LppW  71.1 
 
 
310 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5916  beta-lactamase  70.61 
 
 
310 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545883  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2191  putative alanine rich lipoprotein LppW  58.75 
 
 
312 aa  331  9e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0244212  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12919  lipoprotein lppW  50.16 
 
 
314 aa  290  2e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.344299 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1969  putative alanine rich lipoprotein LppW  53.61 
 
 
308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116231  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2015  putative alanine rich lipoprotein LppW  53.61 
 
 
308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.522288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1949  putative alanine rich lipoprotein LppW  53.61 
 
 
308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4171  putative alanine rich lipoprotein LppW  53.75 
 
 
312 aa  269  4e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2719  beta-lactamase  42.86 
 
 
284 aa  126  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2675  hypothetical protein  34.71 
 
 
311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000577848  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0507  putative secreted protein  28.71 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5365  hypothetical protein  30.4 
 
 
253 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2833  hypothetical protein  29.96 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.13197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8336  Beta-lactamase class A-like protein  30.59 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5325  hypothetical protein  29.2 
 
 
253 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3689  hypothetical protein  29.2 
 
 
253 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5685  hypothetical protein  29.2 
 
 
253 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.410744 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4074  hypothetical protein  32.75 
 
 
311 aa  59.7  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.78309  normal  0.0391067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4473  hypothetical protein  30 
 
 
303 aa  59.7  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0150  hypothetical protein  29.31 
 
 
304 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4075  hypothetical protein  27.78 
 
 
310 aa  53.5  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0355781 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4900  hypothetical protein  27.16 
 
 
296 aa  52.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2311  putative secreted protein  29.5 
 
 
316 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4474  hypothetical protein  26.77 
 
 
301 aa  49.7  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.334004  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5344  hypothetical protein  29.31 
 
 
281 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7334  hypothetical protein  28.07 
 
 
317 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0158  hypothetical protein  32.09 
 
 
259 aa  42.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>