22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2719 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2719  beta-lactamase  100 
 
 
284 aa  554  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0952  beta-lactamase  42.86 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.233942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5916  beta-lactamase  41.62 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545883  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5336  putative alanine rich lipoprotein LppW  37.76 
 
 
310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5425  putative alanine rich lipoprotein LppW  37.76 
 
 
310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5715  putative alanine rich lipoprotein LppW  38.5 
 
 
310 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2191  putative alanine rich lipoprotein LppW  35.43 
 
 
312 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0244212  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12919  lipoprotein lppW  34.51 
 
 
314 aa  106  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.344299 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4171  putative alanine rich lipoprotein LppW  36.82 
 
 
312 aa  102  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1969  putative alanine rich lipoprotein LppW  37.13 
 
 
308 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116231  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1949  putative alanine rich lipoprotein LppW  37.13 
 
 
308 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2015  putative alanine rich lipoprotein LppW  37.13 
 
 
308 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.522288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2675  hypothetical protein  37.16 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000577848  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3689  hypothetical protein  30.1 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5325  hypothetical protein  30.1 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5685  hypothetical protein  30.1 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.410744 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0507  putative secreted protein  34.1 
 
 
326 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2833  hypothetical protein  32.75 
 
 
253 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.13197 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5365  hypothetical protein  31.95 
 
 
253 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0150  hypothetical protein  33.92 
 
 
304 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1541  penicillin-binding protein, transpeptidase  21.23 
 
 
265 aa  45.4  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2311  putative secreted protein  39.6 
 
 
316 aa  43.9  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>