65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl466 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl466  cytidine deaminase  100 
 
 
134 aa  275  1e-73  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.063527  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0009  cytidine deaminase  33.6 
 
 
126 aa  95.5  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.080456  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5437  hypothetical protein  31.58 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.491914  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1137  cytidine deaminase  29.23 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000157258  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1606  hypothetical protein  39.39 
 
 
131 aa  57  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1390  hypothetical protein  38.38 
 
 
131 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  33.65 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  29.13 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  31.63 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  31.91 
 
 
131 aa  51.6  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  33.78 
 
 
131 aa  51.6  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  33.33 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  33.33 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  32.89 
 
 
159 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1562  cytidine deaminase  31.17 
 
 
132 aa  47.4  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.546128  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  30.95 
 
 
132 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  30.85 
 
 
127 aa  47.4  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  30.95 
 
 
132 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  30.95 
 
 
132 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  30.95 
 
 
132 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  30.95 
 
 
132 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0498  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  26.09 
 
 
144 aa  47  0.00009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.115067 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  30.95 
 
 
132 aa  47  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0733  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  26.09 
 
 
144 aa  47  0.00009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00269425 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  30.95 
 
 
132 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  30.3 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  34.78 
 
 
131 aa  46.2  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0740  cytidine deaminase  36.11 
 
 
130 aa  47  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0487267 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1731  cytidine deaminase  26.42 
 
 
132 aa  47  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  30.95 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  34.78 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  34.78 
 
 
131 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  34.78 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  34.78 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  31.52 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  34.78 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  34.78 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1835  cytidine deaminase  34.29 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  34.78 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  34.78 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  34.78 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  34.78 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  35.29 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0790  cytidine deaminase  29.29 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000426322  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  29.36 
 
 
132 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1838  cytidine deaminase  30.1 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  28.44 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  29.76 
 
 
132 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  30.93 
 
 
132 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  29.17 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0599  cytidine deaminase  32 
 
 
129 aa  43.5  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  28.42 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2536  cytidine deaminase  28.95 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.289649  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  31.46 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  30.43 
 
 
132 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  30.43 
 
 
132 aa  42  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0754  cytidine deaminase  35.62 
 
 
175 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  30.34 
 
 
132 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3635  cytidine deaminase  29.7 
 
 
142 aa  41.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4804  hypothetical protein  37.97 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.558671  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0827  cytidine deaminase  33.82 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0111434  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1582  cytidine deaminase  23.53 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.993126  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  27.84 
 
 
142 aa  40.4  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3340  cytidine deaminase  22.14 
 
 
152 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.568351 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0622  cytidine deaminase  43.48 
 
 
131 aa  40.8  0.007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>