More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3557 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3557  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 238 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4077  nucleotidyl transferase  48.2 
 
 		 238 aa  208  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.957763  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  43.69 
 
 		 238 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0409  Nucleotidyl transferase  44.34 
 
 		 237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.359368 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3723  Nucleotidyl transferase  45.05 
 
 		 240 aa  187  9e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0885  Nucleotidyl transferase  41.26 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  41.05 
 
 		 843 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4321  Nucleotidyl transferase  40.44 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  42.36 
 
 		 821 aa  176  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  40.97 
 
 		 784 aa  174  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  40.97 
 
 		 784 aa  174  8e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  40.97 
 
 		 784 aa  174  8e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  40.97 
 
 		 784 aa  174  9e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  40.97 
 
 		 784 aa  174  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  40.97 
 
 		 784 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  40.97 
 
 		 784 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1968  nucleotidyltransferase family protein  40.71 
 
 		 476 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  40.17 
 
 		 841 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  40.53 
 
 		 784 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  40.53 
 
 		 784 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  40.17 
 
 		 832 aa  171  9e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  39.46 
 
 		 828 aa  171  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  40.18 
 
 		 820 aa  168  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  40 
 
 		 784 aa  167  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  40.17 
 
 		 833 aa  166  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  40.81 
 
 		 828 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  37.02 
 
 		 828 aa  166  4e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  39.74 
 
 		 832 aa  165  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  40.64 
 
 		 349 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  35.71 
 
 		 843 aa  164  9e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  38.77 
 
 		 854 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  38.86 
 
 		 832 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  39.04 
 
 		 827 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  39.21 
 
 		 785 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  38.77 
 
 		 835 aa  163  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  39.91 
 
 		 827 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  37.44 
 
 		 835 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  41.48 
 
 		 834 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  38.77 
 
 		 828 aa  161  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  37.99 
 
 		 842 aa  161  8.000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  35.71 
 
 		 842 aa  160  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  38.77 
 
 		 366 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  40.53 
 
 		 712 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  37.12 
 
 		 842 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1456  nucleotidyl transferase  38.29 
 
 		 361 aa  159  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0541  nucleotidyl transferase  34.38 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  37.28 
 
 		 820 aa  159  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  35.6 
 
 		 841 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  35.32 
 
 		 840 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  37.28 
 
 		 816 aa  158  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  38.33 
 
 		 835 aa  158  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  38.26 
 
 		 835 aa  156  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  37 
 
 		 836 aa  154  9e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  37.44 
 
 		 836 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  37 
 
 		 836 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  36.16 
 
 		 818 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  35.81 
 
 		 348 aa  153  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3979  Nucleotidyl transferase  36.07 
 
 		 360 aa  153  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  37.28 
 
 		 818 aa  152  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.56 
 
 		 836 aa  152  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  36.16 
 
 		 776 aa  152  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  37.89 
 
 		 830 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0365  Nucleotidyl transferase  35.91 
 
 		 355 aa  152  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2301  nucleotidyl transferase  35.47 
 
 		 348 aa  150  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0598  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 348 aa  150  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.534705  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  37.34 
 
 		 833 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4857  nucleotidyl transferase  35.16 
 
 		 351 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.292001 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  36.12 
 
 		 830 aa  148  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0757  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 354 aa  146  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  37.95 
 
 		 810 aa  146  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1511  Nucleotidyl transferase  35.54 
 
 		 388 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125436 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1518  nucleotidyltransferase family protein  33.63 
 
 		 341 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.973367  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  35.71 
 
 		 842 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0154  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35.54 
 
 		 392 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01801  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35.95 
 
 		 392 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26731  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35.68 
 
 		 392 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  38.2 
 
 		 392 aa  143  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0380  nucleotidyltransferase family protein  33.18 
 
 		 341 aa  143  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0289  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  34.85 
 
 		 392 aa  144  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  38.36 
 
 		 370 aa  143  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  36.68 
 
 		 343 aa  143  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1518  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  34.44 
 
 		 392 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  36.07 
 
 		 381 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02241  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  34.44 
 
 		 392 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  37.05 
 
 		 370 aa  142  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2394  nucleotidyl transferase  33.18 
 
 		 346 aa  141  9e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  34.85 
 
 		 389 aa  141  9e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01711  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35.12 
 
 		 392 aa  140  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.602072  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0300  nucleotidyl transferase  33.76 
 
 		 397 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  34.96 
 
 		 361 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  34.96 
 
 		 361 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01681  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35.27 
 
 		 392 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01691  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35.12 
 
 		 392 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1847  nucleotidyl transferase  33.88 
 
 		 389 aa  139  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.315582  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  37.9 
 
 		 370 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01171  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  36.12 
 
 		 320 aa  139  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  36.53 
 
 		 347 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1489  nucleotidyl transferase  40.33 
 
 		 230 aa  138  6e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.523541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0925  Nucleotidyl transferase  33.88 
 
 		 388 aa  138  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0952  Nucleotidyl transferase  33.88 
 
 		 388 aa  138  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>