159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2933 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2933  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  677    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.131666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3159  hypothetical protein  99.71 
 
 
342 aa  674    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.526515  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3115  hypothetical protein  95.32 
 
 
342 aa  621  1e-177  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0088  hypothetical protein  59.13 
 
 
337 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0965  hypothetical protein  56.98 
 
 
337 aa  340  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1292  hypothetical protein  56.09 
 
 
353 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3552  hypothetical protein  46.64 
 
 
328 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0612  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  47.57 
 
 
326 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936989  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0855  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  47.57 
 
 
404 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1044  putative acetylesterase  47.57 
 
 
326 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.475385  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2345  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  47.57 
 
 
417 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  49.61 
 
 
326 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.984034  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1651  hypothetical protein  48.06 
 
 
339 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.744803  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1129  putative acetylesterase  47.59 
 
 
328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1921  hypothetical protein  47.08 
 
 
327 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3521  esterase/lipase-like protein  44.81 
 
 
333 aa  229  5e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0181  hypothetical protein  46.61 
 
 
329 aa  226  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.799105  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1902  pectin acetylesterase  44.98 
 
 
320 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.501568  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1954  pectin acetylesterase  45.78 
 
 
308 aa  224  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1964  pectin acetylesterase  43.36 
 
 
308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.235642  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2195  pectin acetylesterase  43.37 
 
 
318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1536  hypothetical protein  47.29 
 
 
314 aa  220  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2039  pectin acetylesterase  44.8 
 
 
314 aa  218  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.773427  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0225  pectin acetylesterase  43.53 
 
 
324 aa  210  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0473386  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3038  hypothetical protein  41.61 
 
 
323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463751  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4266  esterase/lipase-like protein  36.64 
 
 
309 aa  195  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.401395  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000919  endo-1,4-beta-xylanase  40.64 
 
 
303 aa  192  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1345  alpha/beta hydrolase  38.26 
 
 
305 aa  186  6e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1417  esterase/lipase  37.02 
 
 
310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.895698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0283  esterase/lipase  37.59 
 
 
303 aa  178  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5554  xylanase  37.37 
 
 
286 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0342677 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2001  xylanase  38.44 
 
 
301 aa  177  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3062  esterase/lipase-like protein  35.4 
 
 
333 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.851787  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1924  pectin acetylesterase  36.25 
 
 
319 aa  176  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000155025  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3550  alpha/beta hydrolase  34.72 
 
 
306 aa  174  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0287748  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4537  xylanase  39.12 
 
 
301 aa  173  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664665  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4918  putative esterase/lipase precursor  36.93 
 
 
299 aa  169  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.220535  normal  0.753644 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2905  xylanase  36.43 
 
 
333 aa  160  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.641285  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3894  esterase/lipase-like protein  34.15 
 
 
301 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3975  hypothetical protein  35.34 
 
 
289 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1805  Esterase/lipase  33.33 
 
 
281 aa  156  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.90276  hitchhiker  0.0000000160109 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2906  xylanase  36.34 
 
 
319 aa  153  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3031  hypothetical protein  36.18 
 
 
293 aa  150  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2213  esterase/lipase-like protein  35.78 
 
 
267 aa  146  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000722209  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2025  Alpha/beta hydrolase  37.25 
 
 
301 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0188  Esterase/lipase-like protein  37.13 
 
 
346 aa  145  1e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.871358 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2181  putative lipase/esterase  40.17 
 
 
258 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144182 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2345  hypothetical protein  31.09 
 
 
274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2427  endo-1,4-beta-xylanase B  37.66 
 
 
270 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.740371  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0788  esterase/lipase-like  33.21 
 
 
305 aa  116  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2431  endo-1,4-beta-xylanase  29.41 
 
 
291 aa  112  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0212534  normal  0.300404 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2402  hypothetical protein  30.36 
 
 
319 aa  109  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.50924 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01948  xylanase  36.28 
 
 
249 aa  109  9.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3784  hypothetical protein  30.87 
 
 
303 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000474919 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3014  acetyl esterase  35.85 
 
 
277 aa  106  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0258039  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1260  lipase/esterase family protein  32.44 
 
 
280 aa  105  9e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119975 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1475  esterase/lipase  33.06 
 
 
277 aa  102  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0112  esterase/lipase  29.27 
 
 
272 aa  99.8  6e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  7.81923e-16 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1712  esterase/lipase-like protein  31.08 
 
 
334 aa  99  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01320  conserved hypothetical protein  28.5 
 
 
255 aa  97.1  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000546639  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1216  putative esterase  28.35 
 
 
287 aa  94.7  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.274462  normal  0.128321 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2271  alpha/beta hydrolase  32.55 
 
 
325 aa  94.4  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0661  esterase/lipase-like protein  28.22 
 
 
371 aa  92.4  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0519166  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22340  esterase/lipase  29.77 
 
 
261 aa  89.4  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.308782  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1725  hypothetical protein  28.21 
 
 
308 aa  87  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3216  hypothetical protein  27.43 
 
 
317 aa  85.9  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.476052  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  31.63 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0809  xylanase  31.85 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1562  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.15 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0485  esterase/lipase  25 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1549  esterase/lipase-like protein  26.12 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4378  Esterase/lipase-like protein  24.07 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3240  hypothetical protein  28.19 
 
 
333 aa  63.2  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4253  esterase/lipase-like protein  24.15 
 
 
318 aa  63.2  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0978  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.76 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.689687  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0810  hypothetical protein  24.91 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2516  Esterase/lipase-like protein  30.14 
 
 
329 aa  60.5  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228669  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0015  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  24.91 
 
 
344 aa  57.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  24.54 
 
 
308 aa  57  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1433  exported protein precursor  27.59 
 
 
326 aa  56.6  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3898  hypothetical protein  27.75 
 
 
358 aa  56.2  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0640  Alpha/beta hydrolase  26.42 
 
 
303 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  26.63 
 
 
269 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2793  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.72 
 
 
420 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1051  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.99 
 
 
349 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.696352  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2759  Alpha/beta hydrolase fold-3  27.75 
 
 
336 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2589  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.35 
 
 
300 aa  53.9  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3193  putative esterase  26.27 
 
 
280 aa  53.5  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0449  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.08 
 
 
321 aa  52.8  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1454  esterase/lipase/thioesterase  24.7 
 
 
411 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0950589  hitchhiker  0.0024577 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  24.64 
 
 
300 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  28.45 
 
 
593 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3997  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.77 
 
 
343 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3625  putative esterase  24.72 
 
 
283 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000216129  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0304  putative lipase  24.14 
 
 
334 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.726693  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0299  lipase, putative  24.63 
 
 
334 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  27.54 
 
 
309 aa  50.8  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4020  hypothetical protein  25.66 
 
 
325 aa  50.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949224 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.4 
 
 
324 aa  49.7  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1511  esterase/lipase-like  25.34 
 
 
391 aa  49.7  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000319912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>