20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1686 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1686  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  200  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4434  hypothetical protein  59.74 
 
 		 366 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1035  hypothetical protein  59.72 
 
 		 365 aa  94  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4323  major royal jelly protein  54.93 
 
 		 352 aa  82.8  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.230264 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1404  hypothetical protein  57.33 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1433  major royal jelly protein  47.3 
 
 		 358 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1997  hypothetical protein  48.81 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00526041  normal  0.034597 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 		 545 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2687  hypothetical protein  39.44 
 
 		 377 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1771  hypothetical protein  39.13 
 
 		 383 aa  51.2  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0307  hypothetical protein  34.78 
 
 		 383 aa  46.2  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0589  major royal jelly protein  40.32 
 
 		 388 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.625043  normal  0.0999995 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1436  hypothetical protein  31.75 
 
 		 415 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1158  major royal jelly protein  34.43 
 
 		 409 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0613  hypothetical protein  38.71 
 
 		 388 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.112882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0624  major royal jelly protein  38.71 
 
 		 388 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  34.78 
 
 		 963 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2714  hypothetical protein  33.33 
 
 		 383 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299104 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2718  hypothetical protein  31.82 
 
 		 394 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4481  hypothetical protein  33.33 
 
 		 386 aa  40.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0686114  normal  0.461484 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>