35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0953 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0953  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  801    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1760  hypothetical protein  77.07 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1023  hypothetical protein  76 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.486494  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0921  hypothetical protein  74.93 
 
 		 396 aa  564  1e-160  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1034  hypothetical protein  59.9 
 
 		 404 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1301  amine oxidase  41.75 
 
 		 425 aa  285  9e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3414  phytoene dehydrogenase family protein  39.24 
 
 		 425 aa  268  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  24.85 
 
 		 499 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  51.22 
 
 		 407 aa  50.8  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0519  hypothetical protein  21.37 
 
 		 412 aa  50.1  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.696387  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  22.39 
 
 		 453 aa  50.1  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  24.4 
 
 		 453 aa  49.7  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  20.73 
 
 		 512 aa  49.7  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  22.45 
 
 		 519 aa  48.9  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1492  hypothetical protein  24.51 
 
 		 436 aa  48.1  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0711656 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  23.21 
 
 		 453 aa  48.9  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  24.54 
 
 		 499 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1328  hypothetical protein  52.78 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3173  amine oxidase  52.78 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0714711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  21.88 
 
 		 506 aa  46.2  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3017  amine oxidase  50 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  26.89 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2736  amine oxidase  50 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0638  hypothetical protein  50 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000186691  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0933  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  26.51 
 
 		 474 aa  44.7  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  47.37 
 
 		 482 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003863  amine oxidase flavin-containing  44.19 
 
 		 436 aa  44.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  35.9 
 
 		 520 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  55.26 
 
 		 486 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01816  hypothetical protein  51.43 
 
 		 436 aa  43.5  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4739  amine oxidase  40.48 
 
 		 415 aa  43.5  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  34.62 
 
 		 520 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  52.63 
 
 		 486 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  22.55 
 
 		 512 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>